Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 249A09 and hit At3g06120 are shown.
Line ID 249A09
Locus At3g06120 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr3:1847701
Primers used for PCR CP92 - 8474, show primer details
   
Sequence Name 80-K105358-0022-249-A09C-CP92
GenBank Accession LN513954 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, CP92: 5'-CACACATTTACATTCGGATGATTC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>80-K105358-0022-249-A09C-CP92
TGTCATGATTTATTGTGGGAAATTACAACGTTGATCAACTTCGGATACAACAACAAACTA
AGTAAAACATAAGTGTGTTTTTTTAAAAGAAGGTTTTGTTTAGAGGAGCTTATTTCTAGC
AAAGTATCAAGGCTCATGTAACGATTATATGATTATTAATCCCAAAAAACGATACACGCT
CTAGTACATGTAGAATTTTGTTTTTAATTGGTAGAGACGATCACTTCATCAGACACAAAG
CTTTTCTGAACTTCAAGAGTTAGCTCCTCCAAGCTTAAGTGACACTCCAATCCTATCTGC
ACATGTAAATTTAATTCCGTCGAATTCAAAACAAAAGACTCATACAAATATTATCTGATC
CATATATATATACATTGAGCTTAACTAATAATATTGATATATCTTTTGGTGTAAATTAAA
GAAGTACAAATCAAGTTAAATAGTCATAATTTGGTTAAGTAACTAAATCGATGCAAGACA
TCGGTTTAGCAATAATTGGTGTTTGATCATTCATTAGGATATATTCAATTGTAAATGGCT
TCATGTCCGGGAAATCTACATGGATCAGCAATGAGTATGATGGTCAATATGGAGAAAAAG
AAAGAGTAATTACCAATTTTTTTTCAATTCAAAAATGTAGATGTCCGC
   
Sequence Name 64-K105359-0022-249-A09C-8409
GenBank Accession LN511201 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>64-K105359-0022-249-A09C-8409
GCATTTACATTGAATATATCCTAATGAATGATCAAACACCAATTATTGCTAAACCGATGT
CTTGCATCGATTTAGTTACTTAACCAAATTATGACTATTTAACTTGATTTGTACTTCTTT
AATTTACACCAAAAGATATATCAATATTATTAGTTAAGCTCAATGTATATATATATGGAT
CAGATAATATTTGTATGAGTCTTTTGTTTTGAATTCGACGGAATTAAATTTACATGTGCA
GATAGGATTGGAGTGTCACTTAAGCTTGGAGGAGCTAACTCTTGAAGTTCAGAAAAGCTT
TGTGTCTGATGAAGTGATCGTCTCTACCAATTAAAAACAAAATTCTACATGTACTAGAGC
GTGTATCGTTTTTTGGGATTAATAATCATATAATCGTTACATGAGCCTTGATACTTTGCT
AGAAATAAGCTCCTCTAAACAAAACCTTCTTTTTAAAAAAACACACTTATGTTTTACTTA
GTTTGTTGTTGTATCCGAAGTTGATCAACGTTGTAATTTCCCACAATAAATCATGACATT
TTATATGCTCTAATTAACTAGTATAATATAGTTCTGAATCATCCGAATGTAAATGTGTG

Last Updated on 06.12.2018 16:11