Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 414B10 and hit At2g33710 are shown.
Line ID 414B10
Locus At2g33710 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr2:14258723
Primers used for PCR 40xm - 8474, show primer details
   
Sequence Name 22-K119249-0022-414-B10C-40xm
GenBank Accession LN496336 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 40xm: 5'-CAAATGTATTTGAACCGCCTAGTT-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined)
>22-K119249-0022-414-B10C-40xm
TTTTGTTACATTAGTTTTATATATCCTAAAAACCAAAAATCGATTTATAATCCAATAAAA
AAATATGGCTGCTTTGCCAATTCAATTGATTCTGATCTGAAACTAAAACCGCAATTTTTG
TTTGTGTTGATTACTTGATTACTGTTTTTAAGAAATCTTTAAGCTCACAATAAAGAAACT
AACAAATTGAAAATTCCTAGATAAATTAATTCATTTGAAAAAAATGAATCTAAAATTTTC
ATATTTTACACCACAGCAAATAGCACTTGATATTGAATCAACATTAAATAGTATTCGTTC
TTTTACTTTTAAAAATCCATTAAAAATCAGGGTATCACCTATATGTTATAGTCATTAGAA
CATAAATATAAATTATATATGTGTGTGTTTCATTGTTATACATATTAACACACTGATATA
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GAACAAGATTAAAAGAAGCCTGTTTTCTTTGAGTTCATCTCTATATTTTTTCTTTCTTTT
TTCTTTTTGTATTTTGTTTGTTGTGATTTGTGAGTTATGATGGTAATTTGTGTTCTAAAT
TGGGTTTAATATATTAGGATAGTTTTTATCCTCTTTTATGAGGTCAATACATACAAATGA
TTTTGGTATTAAAATGTTTAGATTTCATACCTATATTATTTATTATGATTAATTGAGAAA
CACTATATAAAACAATAGCAATTTATGATATCATATACTATTATTGTTTAATGAATCTAT
ACGTAAATTATTATGTTTTGATGATACATAGCATTTAACATAAATAGTGT
   
Sequence Name 06-K119248-0022-414-B10C-8409
GenBank Accession LN489030 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined)
>06-K119248-0022-414-B10C-8409
GCCATTTACATTGAATTGCAATGATAATATCTGTCTTATTATCCAATGCTCATATATTTT
TCAACGCGTTGAATGATGAAATGGTTGGTAAATAAAAATGAAACTAAACTAGGTAACAGT
CTGCATATGAAACGATTAAAAAACGATTCAAGTAAAATTATTATAAATAAATTATTATAT
AGGATACACATATCGACTGCTAGTGTATAAAACAAAACATGTAGTAAAAGTTTTTTTGTT
CTATTCAAATTTGCGATTATTTCATATAAGTGTATCTTTCACCAGTTAAATAACTGAATG
GAGAAAAAGGTTCAACATTATGAAAAATTATTCATGAAAATTATTATCTGTGAAAATATG
TTTTATGTTTTTAAAAATCAAATTCACATCTTGTGTGTTTTATTGAGTAATCAGAACCAT
TTAACCTGTTTTTTGCAAAAAAAAAAAAAAAATCCCGTATTTTGGGGAAAAATTCCAAAA
AAATTCGGGTTCCCAAATTTAAAACCAAAACTAATTGCCCTTTAAAAGAATTACTGGGGG
ACCTTATAAAATCTCCCTTTTTTTTTTAAAAGGCAATGTATCACCAAAACAAAAAATTTT
CCTTTAGGTTCCTTTAACCAAAAAAAGTATTGGATTCCAAAATTGGCTATGGTTTTAAA

Last Updated on 06.12.2018 16:11