Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line SALK_012141 and hit At4g33230 are shown.
Line ID SALK_012141
Locus At4g33230 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr4:16027098
Primers used for PCR 06rr - LBb3, show primer details
   
Sequence Name 40-K116392-SALK_012141C-06rr
GenBank Accession LN485297 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 06rr: 5'-AAAGCCTTAAAACTTGTTTCGTGA-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>40-K116392-SALK_012141C-06rr
AAAATTAACTTTGCCTCACTAAGTTTATGTTCTATTATCTTGTACTCCAAGGTGCAATTT
GATCTTTACCCACATCAATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGCCCCCCTTTTGGTTTTT
TTTAAACCTCGAAAGGGCCAAGTTTAACCGGAAACCCTTTGGGTGGGAACCCTTCCCCTT
GGAAAAAGGGCCCCCCCGAAAATTTCCCCCCCCCCTCCTTTTTTAAAACCCAAAACCCGG
GGCTTTTAACCCTAAGCGGGGGTGCCCCCTTGGGAACAATTTTTTTGTTTTCCCGGAAAA
AAAATTTTTCGAAAAAAAAATCCTTTTTTTGGCTTTTTAACCAACCAAGGGGGACGAACC
CCCCCCCGATTGGTAATTCCCCCCAAAATGTTCAAAAAGGGGGTTTCCTGGGCCGGCCAA
AAAAACTTTTAAAAGGGGCCTTTAGGGGTTAAAAAATTTTTTTTGGAACAACTTGAACTT
TGGGGAAAAAAAACCCGGGCCGAAAAAAATTAACCCCCCCCCCTTAAACCCCCCCCGGTT
TTTTTCCCCCCGGAAAACTTTTTTTAAAAAAAAATTCCAATTTTGGAAAAATCCGGGCCC
CCCCCCCAAAAAAAAAAACCATTTCCCCCCCGGGAATTTTTGGGGGGAAAAAAAATTGGC
CCTTAAAACATTTAAAAAACATTTGGGGAATTTTTTAAAGGACGGGGGGGGTTTTTTTTT
TCCCCCAGAAAGAGGGAAACAGGTTAATGCCCTTCCCCCCCCGGCCCAAAAAAATTTTCA
AA
   
Sequence Name 15-K116391-SALK_012141C-R210
GenBank Accession LN484703 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, R210: 5'-CCCAGTACATTAAAAACGTCCGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>15-K116391-SALK_012141C-R210
AATATATCCTGGCGGGACAGTTGATTTCATCTTCGGTGATGCGGCCGCGATTTTCCAGAA
CTGTGACATCTTTATCAGAAAAGGTTTACCGGGGCAGAAGAACACGGTGACGGCTCAAGG
ACGAGTGGATAAGTTTCAGACGACAGGCTTTGTGATCCACAACTGTACAGTTGCTCCAAA
CGAAGATCTTAAACCCGTAAAGGCCCAGTTCAAGAGCTATCTCGGCCGGCCATGGAAACC
CCATTCTCGAACAGTCGTGATGGAATCAACGATCGAGGATGTGATCGATCCTGTTGGTTG
GTTGAGATGGCAAGAGACGGATTTTGCTATCGATACATTGTCTTACGCGGAATACAAGAA
TGATGGTCCAAGCGGAGCAACCGCTGCTAGGGTTAAATGGCCTGGATTTAGGGTTTTAAA
CAAGGAAGAGGCGATGAAATTTACGGTGGGGCCATTCTTACAAGGGGAATGGATCCAAGC
GATAGGGTCTCCGGTTAAGCTTGGCCTTTACGATGCTTAATAAACACGTAAGGTGGTGCC
TTGTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTGGGGGGGGAAAAAAAAAAATTGCCCCTTGGGAACCC
AAAAAAAAAAACCTTACCTTTTTTGGGGGAAATTTAAATTTTTTTTTTCAAAAAATGGTT
TTCCCCCAAATTTTTTTGCCAAAA

Last Updated on 06.12.2018 16:11