Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line SALK_013567c and hit At1g13900 are shown.
Line ID SALK_013567c
Locus At1g13900 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr1:4753601
Primers used for PCR BI56 - LBb3, show primer details
   
Sequence Name 48-K107479-SALK_013567C-BI56
GenBank Accession LN485452 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, BI56: 5'-CCTTCCACAAAATACCATTGTTCT-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>48-K107479-SALK_013567C-BI56
TCCTCTTCTTTTTTTACGTTTGAACGTTGTGATTTTCTTCTTTATTCATTCTTTGCTATG
AAAATTGTCAATATTAACGCATTTGATTCAATTTTTTTTCTCAAGCTTAAATTTTCCAGA
CAATATTCCATGAGTGTTTAATCCTAATATATTGAATTGATCCAATCTAAATCAAACCGA
TCCAAATAAATTAATCTAATTTACCTTTTGATATTCAAAAAGCATATAACCAAACAAAAA
TAGAAAACATCAAATCCATACTATAATTGGTTACACTTATGCTTTGGCATAATCAACATT
CCAATGCTCGATTGATTAGCCTCTACAATTGTTGAATGTATATATACTCTCATACACTAC
ATAATGTAATTACAGCAAAACTTCTTCAATCTGTAATTACAGCAAATTCTTCAAAAAAAA
ACACATGAATCATACTATGTAACAAGAATCACTATTATTATAGTGCACAAAAACTTATGT
TATATATCTTCCCAGCTGTAGTTGTAAAGAAACATGGTTCTTACCGTGGGAAAAAAAGGA
TACTATACAAATCGTGCCTCTAAATAATAGACTCAGTTCAACATTATGTGATTATGTCTC
CTCGTTCTTGACTGGGATCCAACGGTTTCCAGACGAAGATTTCTTTCCCCGGGTAAAAAA
CCCGATAATGAACCCTAAAAGCACACCCACAACCATCAATTGGTCCTTTGACGCGGTACT
TCAATAACACATTGCGGGACAACTGATAGTTTAAACAGATTGTCGTTTCCCGCCTTCAAC
CCCAGGATATATTGTGGTGTAAACAAATTGACGCTTAGACAACTTAATAACACATTGCGG
ACGTTTTTAATGTACTGGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGATT
GCCCTTCACCGCCTGGCCCTG
   
Sequence Name 64-K107480-SALK_013567C-LBb3
GenBank Accession LN485838 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, LBb3: 5'-ATTTTGCCGATTTCGGAAC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>64-K107480-SALK_013567C-LBb3
GGCAACCAGCGTGGACCGCTTGCTGCAACTCTCTCAGGGCCAGGCGGTGAAGGGCAATCA
GCTGTTGCCCGTCTCACTGGTGAAAAGAAAAACCACCCCAGTACATTAAAAACGTCCGCA
ATGTGTTATTAAGTTGTCTAAGCGTCAATTTGTTTACACCACAATATATCCTGGGGTTGA
AGGCGGGAAACGACAATCTGTTTAAACTATCAGTTGTCCCGCAATGTGTTATTGAAGTAC
CGCGTCAAAGGACCAATTGATGGTTGTGGGTGTGCTTTTAGGGTTCATTATCGGGTTTTT
TACCCGGGGAAAGAAATCTTCGTCTGGAAACCGTTGGATCCCAGTCAAGAACGAGGAGAC
ATAATCACATAATGTTGAACTGAGTCTATTATTTAGAGGCACGATTTGTATAGTATCCTT
TTTTTCCCACGGTAAGAACCATGTTTCTTTACAACTACAGCTGGGAAGATATATAACATA
AGTTTTTGTGCACTATAATAATAGTGATTCTTGTTACATAGTATGATTCATGTGTTTTTT
TTTGAAGAATTTGCTGTAATTACAGATTGAAGAAGTTTTGCTGTAATTACATTATGTAGT
GTATGAGAGTATATATACATTCAACAATTGTAGAGGCTAATCAATCGAGCATTGGAATGT
TGATTATGCCAAAGCATAAGTGTAACCAATTATAGTATGGATTTGATGTTTTCTATTTTT
GTTTGGTTATATGCTTTTTGAATATCAAAAGGTAAATTAGATTAATTTATTTGGATCGGT
TTGATTTAGATTGGATCAATTCAATATATTAGGATTAAACACTCATGGAATATTGTCTGG
AAAATTTAAGCTTGAGAAAAAAAATTGAATCAAATGCGTTAATATTGACAAATTTCATAG

Last Updated on 06.12.2018 16:11