Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line SALK_043690c and hit At5g54680 are shown.
Line ID SALK_043690c
Locus At5g54680 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr5:22217056
Primers used for PCR 22ea - LBb3, show primer details
   
Sequence Name 62-K110715-SALK_043690C-22ea
GenBank Accession LN485790 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 22ea: 5'-ATGTTCTCGAATATTATCGGTTCG-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined)
>62-K110715-SALK_043690C-22ea
GTTTTCTTTTCATTTAATTTGTTAAAAGCTAAACGGACAAATAGAAAACACATACTACTA
AAACCAAAGAATATTGAAACAAACAAATTAATCAAAACCAGCTTTAGTGGTGTTAGATTG
ATAGGTCTTTAGATTCGTGCTTCTTACTTATTATTGCTAAGATAGTCGACACACACAAAA
AGAAAAATCCATTCTCTTTTGTTAGAAAACATGAATACTTGCCACTATACCGATTTTGAT
TTAAAAAAACAAAAAGATTGTTAATGGACAAATTTTGTCTTTCTAGTGCATATTTACTTA
AAAATTGAAATTATTAAAAAAAATTTAAAACGTATGGATTATATTTGACTATTTGTTTTG
GAATTTAATCCAAAACATATGAAAATTTTGACCGTTTATGAAATGTTGATTTTTATTTTA
CTCTTTAACTCACACACAAACCACATACTTTAAAATTCGAATTAGAGAATTCACTAGGTT
AATGCCCTGATTAGTTAAGTTTGTTGTAAAATGTATTGATATTTGATTTAATATATATAT
GATGATGTAACACATAAAATAAAATAAAAACACGTAAAATGAATTAAAAATAAACTAACA
AATAAAATAAAAACCCTTGGTATGATGGGCCTTGGAAAGCCCAAAAAAAAAGGAAGAGTG
CGCGTGAAAACCACTCTAATTTCTCTGGATTCCAAACAAATTCTGATAACACATTGACGC
TTAGACAACTTAATAACACATTGCGGACGTTTTTAATGTACTGGGGTGGTTTTTCTTTTC
ACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGC
AAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTC
   
Sequence Name 46-K110714-SALK_043690C-R210
GenBank Accession LN485412 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, R210: 5'-CCCAGTACATTAAAAACGTCCGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined)
>46-K110714-SALK_043690C-R210
GTCATGTGTTATCAGAATTTGTTTGGAATCAGAGAAATTAGAGTGGTTTTCACGCGCACT
CTTCCTTTTTTTTTGGGCTTTCCAAGGCCCATCATACCAAGGGTTTTTATTTTATTTGTT
AGTTTATTTTTAATTCATTTTACGTGTTTTTATTTTATTTTATGTGTTACATCATCATAT
ATATATTAAATCAAATATCAATACATTTTACAACAAACTTAACTAATCAGGGCATTAACC
TAGTGAATTCTCTAATTCGAATTTTAAAGTATGTGGTTTGTGTGTGAGTTAAAGAGTAAA
ATAAAAATCAACATTTCATAAACGGTCAAAATTTTCATATGTTTTGGATTAAATTCCAAA
ACAAATAGTCAAATATAATCCATACGTTTTAAATTTTTTTTAATAATTTCAATTTTTAAG
TAAATATGCACTAGAAAGACAAAATTTGTCCATTAACAATCTTTTTGTTTTTTTAAATCA
AAATCGGTATAGTGGCAAGTATTCATGTTTTCTAACAAAAGAGAATGGATTTTTCTTTTT
GTGTGTGTCGACTATCTTAGCAATAATAAGTAAGAAGCACGAATCTAAAGACCTATCAAT
CTAACACCACTAAAGCTGGTTTTGATTAATTTGTTTGTTTCAATATTCTTTGGTTTTAGT
AGTATGTGTTTTCTATTTGTCCGTTTAGCTTTTAACAAATTAAATTGATAAAGAAAACTT
GTGACCATGTTCGTTGGAACGAACCGATAATATTCGAGAAC

Last Updated on 06.12.2018 16:11