Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line SALK_114659 and hit At2g32190 are shown.
Line ID SALK_114659
Locus At2g32190 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr2:13674710
Primers used for PCR SC02 - R204, show primer details
   
Sequence Name 72-K107371-SALK_114659C-SC02
GenBank Accession LN486048 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, SC02: 5'-TTTTGTCAGCATTGTGAGGTTTAG-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>72-K107371-SALK_114659C-SC02
GTAGATTTCCCGTAGAGAAAGCACTAAACTTTTGCTTTGAGAAAGAAAAGAAACTCTTTA
TTAACAAAGAAAGGAATAACATATAACTCAAATAAAGACATGCTGAATTTATCATTTCAT
TCATGGTGCATATTCTAATGTTGTTAAAAGTAAAATATTTCGCATTAGAAAGGTTAACAA
AAACAATAAAAAAGGCATATCTTCATATCATTGTTATATTATATTTTTTGGTTTAAAATA
TTTAAATCCTCTGTCAGAAACCAGAGAGAGGCGTATTAAGGTTTCTGCGTTTTGTTAAAT
TGATCTTGAGCTCTAAAGGCTGTCTAATGCAGTGTTTTATTTAATTAGCCTTTATAAGAT
TTAGGCAAATATACATAAACAACTAAGTAAATATATACTTCCTCTGTTTGAAAATATATT
AGCATATCTCAATAAATATTGAAATAAATATTATTCCTTGCATGTGTGAGTCATTTACTT
ATTCTTAAAATTTGAGTTACATAACAAAAAAAAGGAAGCTTCGTAGCAGTTTTCGTTCGT
CGTTGGAATAAATATATGGAGACTTAGCAATTAATGGTGCCCTCACGCGGTTCTACTAAA
CCGACCTCCTTTTTGCTTCCCTTACCTATATATACATATATCTCTATCTTCACTTCATAT
TAATCTACACCTCTACATACGATTTTCATTAAACACTTTTCAAAAACAAATCATAATCTG
TTCGAAGATGAGCCAATACAGCCAAAACCAATCTTCAGGTTTGTTGTTCTTACAAATTAA
GCATCATATGTTGTCAATCTCGTCATAATGATCATGTATTTCTAAAGTCTTATGGTAATA
AAACTTATGGTGGACAAATTGCGGACACTTAATAACAAATTGACGCTNAGACAACTTAAT
AACACATTGCGGACGTTTTTATGTACTGGGGTGGTTTTTCTTTTCACAGTGAGACGGCAA
CAGCTGATTG
   
Sequence Name 88-K107372-SALK_114659C-R210
GenBank Accession LN486313 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, R210: 5'-CCCAGTACATTAAAAACGTCCGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>88-K107372-SALK_114659C-R210
GTGCTAGCGTCATTTGTTATTAAGTGTCCGCAATTTGTCCACCATAAGTTTTATTACCAT
AAGACTTTAGAAATACATGATCATTATGACGAGATTGACAACATATGATGCTTAATTTGT
AAGAACAACAAACCTGAAGATTGGTTTTGGCTGTATTGGCTCATCTTCGAACAGATTATG
ATTTGTTTTTGAAAAGTGTTTAATGAAAATCGTATGTAGAGGTGTAGATTAATATGAAGT
GAAGATAGAGATATATGTATATATAGGTAAGGGAAGCAAAAAGGAGGTCGGTTTAGTAGA
ACCGCGTGAGGGCACCATTAATTGCTAAGTCTCCATATATTTATTCCAACGACGAACGAA
AACTGCTACGAAGCTTCCTTTTTTTTGTTATGTAACTCAAATTTTAAGAATAAGTAAATG
ACTCACACATGCAAGGAATAATATTTATTTCAATATTTATTGAGATATGCTAATATATTT
TCAAACAGAGGAAGTATATATTTACTTAGTTGTTTATGTATATTTGCCTAAATCTTATAA
AGGCTAATTAAATAAAACACTGCATTAGACAGCCTTTAGAGCTCAAGATCAATTTAACAA
AACGCAGAAACCTTAATACGCCTCTCTCTGGTTTCTGACAGAGGATTTAAATATTTTAAA
CCAAAAAATATAATATAACAATGATATGAAGATATGCCTTTTTTATTGTTTTTGTTAACC
TTTCTAATGCGAAATATTTTACTTTTAACAACATTAGAATATGCACCATGAATGAAATGA
TAAATTCAGCATGTCTTTATTTGAGTTATATGTTATTCCTTTCTTTGTTAATAAAGAGTT
TCTTTTCTTTCTCAAAGCAAAAGTTTAGTGCTTTCTCTACGGGAATATCTACATGTTAAT
TAAGAAAAGAGAGAATATTACAACTAACCTC

Last Updated on 06.12.2018 16:11