Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line SALK_116659 and hit At5g50720 are shown.
Line ID SALK_116659
Locus At5g50720 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr5:20633781
Primers used for PCR 47fx - LBb3, show primer details
   
Sequence Name 66-K111812-SALK_116659C-47fx
GenBank Accession LN485897 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 47fx: 5'-TGTTAAAACGTTTCTGGATGACTG-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined)
>66-K111812-SALK_116659C-47fx
GTTAGCTTATGTGTTGACAAGAAATCATTTTACTGATCCTCCCGCATCGTCTACTTGGAT
ATTTTAACGCGTGCATATTTGAACATTACTGTGCAAGGTTTAAGGTAGTGAGATCAAACT
TTAATTTGACAAGTTTAAAAATTATATCTGTTTTGAATTTTAAATAAGTGATTTCTAATC
TACAGAGATTTGTATTGCTTAAGTTGTATAAGAATTCTATTTGATCTTATATTAAGTATT
AAAATTTAAGGCAATGATATCTTGAAAGACTAAGAAGTGGCAACACAAGATTTACAATTT
TTTAATCTTTAATATAATAGTTTAACGTCGAATAAAAGGTCTTTTCATACATTCAAGCAG
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TGATTCGTAAAATGTTTAGACTCGAAACAAACCGGGATTGAACCGGCCGTCCTACGGGGC
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AATCAAGTGTCTNTACGAAATTAAGATATAAACTTAGTTCATAAGAAATTAAAAGATATA
TNGTGGTGTAAACAAATTGACGCTNAGACNACTTAATAACACATTGCGGACGTTTTTAAT
GTACTGGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCG
CCCGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCAGCAGGCGAAAATC
CTGTTTGATGTGGTTC
   
Sequence Name 56-K111811-SALK_116659C-R210
GenBank Accession LN485643 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, R210: 5'-CCCAGTACATTAAAAACGTCCGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined)
>56-K111811-SALK_116659C-R210
TTTGTTTCACCACAATATATCTTTTAATTTCTTATGAACTAAGTTTATATCTTAATTTCG
TAAAGACACTTGATTAAAAGTTGTTGTGGTGGGATAAAAGTCTTTGTGAGGGCCGAACCT
TGTCTTTAATTGGTTGCCCCGTAGGACGGCCGGTTCAATCCCGGTTTGTTTCGAGTCTAA
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AATTGGAGAAAACATAGCTTTTTCTAATAAGTATTAAAACGAATTGGATGAAGTAATGTA
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GAGTCAAAAAGAGCAGGGGACACAAGAGGGCTTCACTGTTGGGGTCTCCAGTTTCTAATC
TCTTTATGCTTTTTCTATTTTGTCTTATTTCTCTTTTGATATACGGAAAAATGGGGTTGT
TCTTATTATGAGCCTCTGCTTGAATGTATGAAAAGACCTTTTATTCGACGTTAAACTATT
ATATTAAAGATTAAAAAATTGTAAATCTTGTGTTGCCACTTCTTAGTCTTTCAAGATATC
ATTGCCTTAAATTTTAATACTTAATATAAGATCAAATAGAATTCTTATACAACTTAAGCA
ATACAAATCTCTGTAGATTAGAAATCACTTATTTAAAATTCAAAACAGATATAATTTTTA
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TGCACGCGTTAAAATATCCAAGTAGACGATGCGGGAGGATCAGTAAAATGATGTTCTTTG
TCAACACATAAGCTTAACATTTCACACATACTCTCATGTAGTGGTGGATCCAGTCATCCA
GAACGTTTTTA

Last Updated on 06.12.2018 16:11