Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line Salk_020809 and hit At1g28090 are shown.
Line ID Salk_020809
Locus At1g28090 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr1:9795636
Primers used for PCR 06bh - LBb3, show primer details
   
Sequence Name 18-K108069-SALK_020809C-06bh
GenBank Accession LN484769 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 06bh: 5'-CCTTTTTGGCTTATCCATTAACAA-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>18-K108069-SALK_020809C-06bh
ATTGAAATTTATTCTTTTGTAGGTTGTACATATAATATATACATTATCGAAACTTTTTAA
ATTTGAAAAATTATAAACTTTTCATAACCTTTTGCAAGTGTTCGTAATGAGTTTAGGAAA
CACAAACTAGGAACAATATGTGTTCATGTATGTTTTAAACTTACAAAAGTTTAATTGTAT
TCTACTTTATTACCCTTAATTTCTGTTTGTTGTCATATTTTCTGTTCAGAAGATATGATC
TAAAAGACTTGAACACAGCTCGGTGTTTGGATTTGTTTTACAACTGTTGGTTCCTGACAA
ACTAAACCGATCCAATTTAATTCGAATAAATTAAATCTTATAAGAAAATACAAACTACAC
TAAAATATGGATAGAATGTGTAATTATTTTTCTATACACGAAACCAAATCCGAATACACT
TCAAAAAAAAAATGACCGAATTTTAATTTTATTTATAAAAACATATATTTTGAATTAACA
TGAACTAATACTTCACCAAACACACACATACCAATTTTTTAGCAGTAACTGTAAATCTAT
ATGGTGGTGTAAACAAATTGACGCTAAGACAACTTAATAACACATTGCGGACGTTTTTAA
TGTACTGGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACC
GCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAA
TCCTGTTTGATGGTGGTTC
   
Sequence Name 29-K108070-SALK_020809C-R210
GenBank Accession LN485099 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, R210: 5'-CCCAGTACATTAAAAACGTCCGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>29-K108070-SALK_020809C-R210
GCGTCATTTGTTACACCCAATATAGATTTACAGTTACTGCTAAAAAATTGGTATGTGTGT
GTTTGGTGAAGTATTAGTTCATGTTAATTCAATATATATGTTTTTATAAATAAAATTAAA
ATTCGGTCATTTTTTTTTTGAAGTGTATTCGGATTTGGTTTCGTGTATAGAAAAATAATT
ACACATTCTATCCATATTTTAGTGTAGTTTGTATTTTCTTATAAGATTTAATTTATTCGA
ATTAAATTGGATCGGTTTAGTTTGTCAGGAACCAACAGTTGTAAAACAAATCCAAACACC
GAGCTGTGTTCAAGTCTTTTAAATCATATCTTCTGAACAGAAAATATGACAACAAACAGA
AATTAAGGGTAATAAAGTAGAATACAATTAAACTTTTGTAAGTTTAAAACATACATGAAC
ACATATGGTTCCTAGTTTGGGTTTCCTAAACTCATTACAAACACTTGCAAAAGGTTATGA
AAAGTTTATAATTTTTCAAATTTAAAAAGTTTCGATAATGTATATATTATATGTACAACC
TACAAAAGATATAAATGTTCAATATATGTTGATACCTTGACGGTCTTACTTTGTTAATGG
ATAAGCCAAAAAGG

Last Updated on 06.12.2018 16:11