Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 408C09 and hit At5g01390 are shown.
Line ID 408C09
Locus At5g01390 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr5:160336
Primers used for PCR 60yq - 8474, show primer details
   
Sequence Name 15-K122381-0022-408-C09C-8409
GenBank Accession queueing for submission to ENA/GenBank
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>15-K122381-0022-408-C09C-8409
TTTATTATGTCCTCGCTTTTGAGGTTTAGTAATGACTGACGACTAGTGAAGTAAAGTCTC
TCCTTATATCTCTTTGCTAAAAGCTTCAATATTTGTTTAATAGTAAACATTGTCAACAGA
TTTGGAAAGACTAAATCAACGTTTAACAATATGTCAAAATGTAATTCAAATTGATTAATC
ATAGTAGCGAAATTTGAAGAACCTTTTTCTTTTGTTGATTAAAAAATCCAAATCTCTACG
TTTTTCTCACATTCTTCAATCTTCTTGACCTTGTCCCGTTTAATTCCTTCACTAAAATCT
TTTCAACCCTCACGTGCTGATGTTGACATGGAATAATTGTTGTTACTTGTCAAATAATAA
GAAGAAGAAAAAACAGACTAATGTATGTTCCTCTTTGATTGTTCTGGTTAGGCAAATTAC
TTGCATATCTCCACATGTACGAATTAGTAATATTCATTCATAAAGTTAGTATGATTTATA
GATTCAAAAAAATAAACACAGATCGAGTTTAGTTTAGTCAAATATTTGAATGTTTTCAAG
AACAAGAAGAGTTTCTGCAATCAACTGAAATATCATTTTCATGGTCTTGGTTCAAAACCA
GCAGTATTACAAACAGTGAGAAAGGTTTTTGGTATTTGTAACAACAATGTATTGTTGCAG
TGACTCCAAATTCAAAAATGGAAGTCATGTGCATTCACCAAGTTACGGCAAAAGTAAAAG
ACTAAACTTATTACTATTTCCGAATAATCCGGAGCGATACCCTAAACAACATTCACCTCA
NAAGTTCTAAATAACACGAATAGGCTGATTTTTGTATATATGCTTTTGGCTGACGTTTTT
TTTTTGTTCTTGGCTTAAAGACTTCAATTCTT
   
Sequence Name 39-K122382-0022-408-C09C-60yq
GenBank Accession queueing for submission to ENA/GenBank
Sequencing primer gene specific primer, 60yq: 5'-TACATGACATGCACTAGACTTCGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>39-K122382-0022-408-C09C-60yq
CCTTATTTATTTAACTAAATTAATAATAATGTCGACTACTCTAGTGAATGATCTTTAATT
TTTCTAATTCTTATGTTCAAAATTTGTGGTCTTTAATTATTTAAAAGAGAAATTGTGAAA
GAAGGAATTTTCTGTGAACAAAAGAAAGAATAATCAGTATTTTTTAATTTTATTTAAATG
GAATCAAATAATCAGCAACGCGGAGTGTTGTTATATTCCACGTGTAAACGCCCACCATGT
TTGTCCACGTGGCCATCTCTCTCTCTGTCTTTCACTTTTTATTTTAACAAAGATTTTTGT
TGGCTGATGTTTATCCGCTCAATACAAGTAGGCCACCTCATCATCCTTTTTATTTCCCAT
CCAAATTTTTGCTTAAAAGAATTGAAGTCTTAAAGCAAAGAACAAAAAAAAAACGTCAGC
CAAAAGCATATATACAAAAATCAGCCTATTCGTGTTATTTAAAACTTTTGAGGTGAATGT
TGTTTAGGGTATCGCTCCGGATTATTCGGAAATAGTAATAAGTTTAGTCTTTTACTTTTG
CCGTAACTTGGTGAATGCACATGACTTCCATTTTTGAATTTGGAGTCACTGCAACAATAC
ATTGTTGTTACAAATACCAAAAACCTTTCTCACTGTTTGTAATACTGCTGGTTTTGAACC
AAGACCATGAAAATGATATTTCAGTTGATTGCAAAAACTCTTCTTGTTCTTGAAAACATT
CAAATATTTGACTAAACTAAACTCGATCTGTGTTTATTTTTTTGAATCTATAAATCATAC
TAACTTTATGAATGAATATAACTAATTCGTACATGTGGAGATATGCAAGTAATTTGCCTA
A

Last Updated on 06.12.2018 16:11