Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 763C08 and hit At5g01490 are shown.
Line ID 763C08
Locus At5g01490 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr5:198275
Primers used for PCR 20os - 8474, show primer details
   
Sequence Name 63-K114954-0022-763-C08C-20os
GenBank Accession LN511049 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 20os: 5'-TCCTGCCAAATATCTTCTGATACG-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>63-K114954-0022-763-C08C-20os
TTTTAGTTTTATTTAATTGTATTCCTATATAGACATGCAGTTCTGACATGTATGAACAAG
GTTTGATTATGTTAGAATTATCTATTACGTTTAATTTACATATTCCTTATAAAAAATGAT
GTAAAAAACAAATTCTTAAAAATATATATACTTACACAATAATTCAAAAACTAAATATGT
AATCAAAGAAAACAACAATACACTAAAAGAAAGACAAAACAATATTCGAGTTACCTGCAA
TTAAAAAAAATAAACAAGAACCATATATCATAATATATAATGTAGTCCGAGAATCTAAAA
ATGATTTAACTTTCTAGAAGTTAGGTTTCTATGATTATCATGATTGCCAGTTGACAGTTA
AAACTAACATTCATCAATATATTTGATAGATTTCTTAAAATGTTACATTTTTGTTTACTA
TATAGTTGATTGTAATTTGATAATTACCAATACAACTAATCATACAATAACGAAAAGGTA
AGTTATGTTTTCTTAATATATTGGTATCAGTTACCAATTTATGTTTAAATGACATCAATA
ATTTTTTATCAATATATTTGATATATTTGATATATTTGTTTACATTTATGTTTAAAGGTA
AGTTAAATGGCTTCATGTCCGGGAAATCTACATGGATCAGCAATGAGTATGATGGTCAAT
ATGGAGAAAAAGAAAGAGTAATTACCAATTTTTTTTCAATTCAAAAATGTAGATGTCCG
   
Sequence Name 29-K114953-0022-763-C08C-8409
GenBank Accession LN499412 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>29-K114953-0022-763-C08C-8409
CATTTACTTACCTTTAACATAAATGTAAACAAATATATCAAATATATCAAATATATTGAT
AAAAAATTATTGATGTCATTTAAACATAAATTGGTAACTGATACCAATATATTAAGAAAA
CATAACTTACCTTTTCGTTATTGTATGATTAGTTGTATTGGTAATTATCAAATTACAATC
AACTATATAGTAAACAAAAATGTAACATTTTAAGAAATCTATCAAATATATTGATGAATG
TTAGTTTTAACTGTCAACTGGCAATCATGATAATCATAGAAACCTAACTTCTAGAAAGTT
AAATCATTTTTAGATTCTCGGACTACATTATATATTATGATATATGGTTCTTGTTTATTT
TTTTTAATTGCAGGTAACTCGAATATTGTTTTGTCTTTCTTTTAGTGTATTGTTGTTTTC
TTTGATTACATATTTAGTTTTTGAATTATTGTGTAAGTATATATATTTTTAAGAATTTGT
TTTTTACATCATTTTTTATAAGGAATATGTAAATTAAACGTAATAGATAATTCTAACATA
ATCAAACCTTGTTCATACATGTCAGAACTGCATGTCTATATNGGAATACAATTAAATTAA
AACTAAAAATATAAATGCCTTCTCATGGAATTTTTTGATTCGTATC

Last Updated on 06.12.2018 16:11