Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 347D10 and hit At5g37800 are shown.
Line ID 347D10
Locus At5g37800 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr5:15037827
Primers used for PCR 10nz - 8474, show primer details
   
Sequence Name 20-K114794-0022-347-D10C-10nz
GenBank Accession LN495326 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 10nz: 5'-TTAACGAACAAAAGTGCAGAAATG-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>20-K114794-0022-347-D10C-10nz
AAATAAATTTAAAAGGGTTTTAAGGAGGATTTAAGTTTTAATTTCTAATGAAATAGTTGA
TTTTTTCGTTGCCTTACTGCATCGTATGTAGAAATATAGACATTCATAATAAATATTTTT
TGTCTTTTAATTACTAAGAGGTTCGGATCTAGGTCTGTTTCTCGGGTAGGAAACCATAAC
ATTTAATATAGTTTCCCCTTAAATGTTATTCGTATCAGTGACTTCTAAACTTTGCATAGA
TGTATTATCGATTAAGCTATTAACACTTAATTACATGCATAATATCTCAAAACTTAACAA
CACTTAGTTCAATTCATGAAAACATTTTATAAAAGATATCTTAAAGTAAAACTCAGAAAC
CAAACTTTTGCAACATCACATTACGCATACTTGGAGAATTACAAAACATACAAAAATAGA
AACATACCTCCACATATATAAGATTCATGTCCACATATATATTCAATTGTAAATGGCTTC
ATGTCCGGGAAATCTACATGGATCAGCAATGAGTATGATGGTCAATATGGAGAAAAAGAA
AGAGTAATTACCAATTTTTTTTCAATTCAAAAATGTAGATGTCCG
   
Sequence Name 07-K114793-0022-347-D10C-8409
GenBank Accession LN489388 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>07-K114793-0022-347-D10C-8409
ATTTACATTGAATATATATGTGGACATGAATCTTATATATGTGGAGGTATGTTTCTATTT
TTGTATGTTTTGTAATTCTCCAAGTATGCGTAATGTGATGTTGCAAAAGTTTGGTTTCTG
AGTTTTACTTTAAGATATCTTTTATAAAATGTTTTCATGAATTGAACTAAGTGTTGTTAA
GTTTTGAGATATTATGCATGTAATTAAGTGTTAATAGCTTAATCGATAATACATCTATGC
AAAGTTTAGAAGTCACTGATACGAATAACATTTAAGGGGAAACTATATTAAATGTTATGG
TTTCCTACCCGAGAAACAGACCTAGATCCGAACCTCTTAGTAATTAAAAGACAAAAAATA
TTTATTATGAATGTCTATATTTCTACATACGATGCAGTAAGGCAACGAAAAAATCAACTA
TTTCATTAGAAATTAAAACTTAAATCCTCCTTAAAACCCTTTTAAATTTATTTTTTCAGT
TGTGACTGTTTAGCTTACGTCCATTTCTGCACTTTGGNTTCGTT

Last Updated on 06.12.2018 16:11