Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 464D02 and hit At5g54680 are shown.
Line ID 464D02
Locus At5g54680 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr5:22217051
Primers used for PCR 22ea - 8474, show primer details
   
Sequence Name 25-K118238-0022-464-D02C-22ea
GenBank Accession LN497654 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 22ea: 5'-ATGTTCTCGAATATTATCGGTTCG-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>25-K118238-0022-464-D02C-22ea
CATTTAATTTGTTAAAGCTAAACGGACAAATAGAAAACACATACTACTAAAACCAAAGAA
TATTGAAACAAACAAATTAATCAAAACCAGCTTTAGTGGTGTTAGATTGATAGGTCTTTA
GATTCGTGCTTCTTACTTATTATTGCTAAGATAGTCGACACACACAAAAAGAAAAATCCA
TTCTCTTTTGTTAGAAAACATGAATACTTGCCACTATACCGATTTTGATTTAAAAAAACA
AAAAGATTGTTAATGGACAAATTTTGTCTTTCTAGTGCATATTTACTTAAAAATTGAAAT
TATTAAAAAAAATTTAAAACGTATGGATTATATTTGACTATTTGTTTTGGAATTTAATCC
AAAACATATGAAAATTTTGACCGTTTATGAAATGTTGATTTTTATTTTACTCTTTAACTC
ACACACAAACCACATACTTTAAAATTCGAATTAGAGAATTCACTAGGTTAATGCCCTGAT
TAGTTAAGTTTGTTGTAAAATGTATTGATATTTGATTTAATATATATATGATGATGTAAC
ACATAAAATAAAATAAAAACACGTAAAATGAATTAAAAATAAACTAACAAATAAAATAAA
AACCCTTGGTATGATGGGCCTTGGAAAGCCCAAAAAAAAAGGAAGAGTGCGCGTGAAAAC
CACTCTAATTTCTCTGGATATATTCAATTGTAAATGGCTTCATGTCCGGGAAATCTACAT
GGATCAGCAATGAGTATGATGGTCAATATGGAGAAAAAGAAAGAGTAATTACCAATTTTT
TTTCAATTCAAAAATGTAGATGTC
   
Sequence Name 11-K118237-0022-464-D02C-8409
GenBank Accession LN491319 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>11-K118237-0022-464-D02C-8409
TTGAAATATCCAGAGAAATTAGAGTGGTTTTCACGCGCACTCTTCCTTTTTTTTTGGGCT
TTCCAAGGCCCATCATACCAAGGNGTTTTTATTTTATTTGTTAGTTTATTTTTAATTCAT
TTTACGTGTTTTTATTTTATTTTATGTGTTACATCATCATATATATATTAAATCAAATAT
CAATACATTTTACAACAAACTTAACTAATCAGGGCATTAACCTAGTGAATTCTCTAATTC
GAATTTTAAAGTATGTGGTTTGTGTGTGAGTTAAAGAGTAAAATAAAAATCAACATTTCA
TAAACGGTCAAAATTTTCATATGTTTTGGATTAAATTCCAAAACAAATAGTCAAATATAA
TCCATACGTTTTAAATTTTTTTTAATAATTTCAATTTTTAAGTAAATATGCACTAGAAAG
ACAAAATTTGTCCATTAACAATCTTTTTGTTTTTTTAAATCAAAATCGGTATAGTGGCAA
GTATTCATGTTTTCTAACAAAAGAGAATGGATTTTTCTTTTTGTGTGTGTCGACTATCTT
AGCAATAATAAGTAAGAAGCACGAATCTAAAGACCTATCAATCTAACACCACTAAAGCTG
GTTTTGATTAATTTGTTTGTTTCAATATTCTTTGGTTTTAGTAGTATGTGTTTTCTATTT
GTCCGTTTAGCTTTTAACAAATTAAATTGATAAAGAAAACTTGTGACCATGTTCGTTGGA
ACGAACCGATAAT

Last Updated on 06.12.2018 16:11