Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 049F01 and hit MIE1 are shown.
Line ID 049F01
Locus MIE1 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr3:4892079
Primers used for PCR EV59 - 8474, show primer details
   
Sequence Name 24-K037322-022-049-F01C-EV59
GenBank Accession LN496910 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, EV59: 5'-AGATTTGGCTGCTTTACAGTGAAT-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>24-K037322-022-049-F01C-EV59
TTTTTTCTTTTCCATGCACGTTGATGGTGTAGATTAACAAACACTTTTTTTTTTCCCATC
AACAAAACTAGTAAAACTACATGTGCCAAAATGCCGGTTTCTGCTTATCTTATTAACTTT
CACTTTAATTAAGTATGTAATTTGTTTGTTTCGGAGAAAAAAGCTTACTTAATTAAAAAG
CTAAGCTTTCCAACTTTAATCTTTCTGACATTTAAAACCAATTATGCAAACTAATTAACA
CTTCCCTCTATTGATTGATTTAATATAATAAATAATAAATCTCAACTTTCTTCTATATGA
ATATGACAATGATTTCAAGGATTTAATCACATCAGGTACTAATAAAAATTTGGACCTACT
ACTTACAAGTTACAATTAGGAATCCAAATTACATTTCTTCCAAAATCGAGGTTTATTATT
ATTTTATTTTGTTTGTATGTGAATTAATTAACCCAATTAGACTAATAAAAAAAGCCGGTC
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TCATGTCCGGGAAATCTACATGGATCAGCAATGAGTATGATGGTCAATATGGAGAAAAAG
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AAATGAAAGTACATTTTGATAAAACGACAAATTACGATCCGTCGTATTTATGGGCGAAAG
CAATAAACAAATTATTCTAATTCGGAAATCTTTATTTCGACGTGTCTAC
   
Sequence Name 32-K037322-022-049-F01C-8409
GenBank Accession LN500495 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>32-K037322-022-049-F01C-8409
GCCATTTCAATTGAATATAAATAGGTGATATAGTATATTTGGAAGAAATATAAATATTGA
CCGGCTTTTTTTATTAGTCTAATTGGGTTAATTAATTCACATACAAACAAAATAAAATAA
TAATAAACCTCGATTTTGGAAGAAATGTAATTTGGATTCCTAATTGTAACTTGTAAGTAG
TAGGTCCAAATTTTTATTAGTACATGATGTGATTAAATCCTTGAAATCATTGTCATATTC
ATATAGAAGAAAGTTGAGATTTATTATTTATTATATTAAATCAATCAATAGAGGGAAGTG
TTAATTAGTTTGCATAATTGGTCTTAAATGTCAGAAAGATTAAAGTTGGAAAGCTTAGCT
TTTTAATTAAGTAAGCTTTTTTCTCCGAAACAAACAAATTACATACTTAATTAAAGTGAA
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TGGGAAAAAAAAAAGTGTTTGTTAATCTACACCATCAACGTGCATGGGAAAAGAAAAAAC
ATTGAAAAAGTTTATTCACTGTAAAGC

Last Updated on 06.12.2018 16:11