Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 093E05 and hit At1g48000 are shown.
Line ID 093E05
Locus At1g48000 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr1:17706647
Primers used for PCR AB84 - 8474, show primer details
   
Sequence Name 46-K017886-022-093-E05C-8409
GenBank Accession LN505717 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>46-K017886-022-093-E05C-8409
CATGTAGATTTCCCGGACATGAAGCCATTTACAATTGATGTTAATCATTGTTAAGCACAT
GCTATAGTTAAGAGTTGGATAAGCTATCAAGTAAGTAAAAGTAACCGAAGAAGTAATTTA
AATTAACATCATTTATTTATCGATATAATTTAGTTGATGCAACAAACCCTTTTTTCTGTA
GTATATAATTTTGTTTAGTTTTGATTCAGGTTTCCTTTTATTAAACCAAACTAGAATTTA
ACCCTCAATATAACACGGGACAATTTTGTTTTCACATAATCTTAACTAAATTAGTGTAAT
TCTACATATTTAATATTAGTGATGTTAATCAAATAATAAAATGAGAATTTCACCGTATTA
TAATGTCGGTTAATGATACTTTTAATTTTTTTAATGTCGATTTAAACTCATTTTTCATAT
ACCCAGTCTCAAAATATAACATGTACTGCGTTATTTTAGACTTTTATATATATTCATTTT
ATTTTAAACTTTATACTGAGTTTAAATATATCAATTATAATATTTCAAAACTTTCAAAGC
TTAAAATTTACTATATCCAGTAAAATTAAACAGTTCAATTAAAAACAGAATTAAACCATA
TACAAACTTTTAAATTTAGATACTTGTTAAGTTAAACTTCTTGTTTATTTAGATTTAGAT
TTATTTATAACATGACTCTTAATCATTTTCTAAACATTTTAGCCCATGT
   
Sequence Name 45-K017886-0022-093-E05C-AB84
GenBank Accession LN505368 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, AB84: 5'-CAACGTCTCAATTTCACATGG-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>45-K017886-0022-093-E05C-AB84
GTTTAGAAAATGATTAAGAGTCATGTTATAAATAAATCTAAATCTAAATAAACAAGAAGT
TTAACTTAACAAGTATCTAAATTTAAAAGTTTGTATATGGTTTAATTCTGTTTTTAATTG
AACTGTTTAATTTTACTGGATATAGTAAATTTTAAGCTTTGAAAGTTTTGAAATATTATA
ATTGATATATTTAAACTCAGTATAAAGTTTAAAATAAAATGAATATATATAAAAGTCTAA
AATAACGCAGTACATGTTATATTTTGAGACTGGGTATATGAAAAATGAGTTTAAATCGAC
ATTAAAAAAATTAAAAGTATCATTAACCGACATTATAATACGGTGAAATTCTCATTTTAT
TATTTGATTAACATCACTAATATTAAATATGTAGAATTACACTAATTTAGTTAAGATTAT
GTGAAAACAAAATTGTCCCGTGTTATATTGAGGGTTAAATTCTAGTTTGGTTTAATAAAA
GGAAACCTGAATCAAAACTAAACAAAATTATATACTACAGAAAAAAGGGTTTGTTGCATC
AACTAAATTATATCGATAAATAAATGATGTTAATTTAAATTACTTCTTCGGTTACTTTTA
CTTACTTGATAGCTTATCCAACTCTTAACTATAGCATGTGCTTAACAATGATTAACATCA
ATTGTAAATGGCTTCATGTCCGGGAAATCTACATGGATCAGCAATGAGTATGATGGCAAT
AT

Last Updated on 06.12.2018 16:11