Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 137A04 and hit At5g09630 are shown.
Line ID 137A04
Locus At5g09630 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr5:2987507
Primers used for PCR 02gj - 8474, show primer details
   
Sequence Name 52-K112131-0022-137-A04C-02gj
GenBank Accession LN507860 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 02gj: 5'-AAGAAGTCAAGGACTCCACTACCA-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>52-K112131-0022-137-A04C-02gj
GAAGTCACGTAACTCAGTTGATTTGTCAGCTTAATCAATTTGTACCTTAAACTTAAATAC
TGTTGCTAATCTAATTTTAGTTAGCTTCATGTTCCTTTTTGACTTTTTGCAACCGGAAAA
CGACAAATAGCTTTGATTTTCATTCTATCAGCTCTCGAATTGGGAATTTAAGGTTATCAA
ATCAATAAGTTAATATGAAACATTTTAATATATTTTTAAAAGAAAATAAAGATAAATATA
ATTACTCACAAAAATTAAAATAACTGTTATGCGAAGAATATGCTGTAATTTATAAGTTTT
TTTTTGGTAATTTTCGTTAAATAGATAGATTTTAATCGTAGAATTTGGGAAAAATATCTG
TTTTTTTTTTCCAAGCTAAATAATTTTGCGGGGCGTTAAAAATAAAATAGTTGTTCCTTG
TTTCCAAAAACCAATCTAAACAATTTAAATCCTCAGGGATTCGGCTGGAATCATCTTTGC
CAATCATCATCTCCCTCTATATTTAACCATTTAAGGGCTTTGGGTTCGTCTCTTTAAAAA
ATTCTAACGGCACAATCAAAATTTCTAATTCGCGTTTCAGGATATATTCAATTGTAAATG
GCTCCATGTCCGGGAAATCTACTGGGATAACCATTGAGTATAATGGTCAATATGGAGAAA
AAAAAAGAGTATTTACCATTTTTTTTTCATTTCAAAAATGTA
   
Sequence Name 36-K112130-0022-137-A04C-8409
GenBank Accession LN502275 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>36-K112130-0022-137-A04C-8409
TTGAATATATCCTGAAACGCGACTGAGAATTTCTGATTGTGCCGTCAGAATTTTTCACAG
AGACGAACCAAAAGCCATTAAATGATGATATATAGAGGGAGATGATGATTGGCAAAGATG
ATCCAAGCCGAATCACTGAGTATCTAAATCGTTAAGATTGGTTTCTGGAAACAAGGAACA
ACTATTTTATTTTCAACGCCCAGCAAAATTATCTAGCTAGGAAAAAAAAAACAAATTTTT
TTCCCAAATTCTACAATAAAAATCTATCTTTTTAACGAAAATTACCAAAAAAAAACTTAT
AATTTACAGCATATTCTTCGCAAAACAGTTATTTTAATTTTGGGGAGTAATTATATTTAT
CTTTATTTTCTTTAAAAAATATATAAAAATGTTTCAAATTAACTTATTGATTTGATAACC
TTAAATTCCCAATTCGAGAGCTGATAGAATGAAAATCAAAGCTTTTTGTCGTTTTCCGGT
TGCAAAAAGTCAAAAAGGAACATGAAGCTAACTAAAATTAGATTACCAACAGTTTTTAAT
TTTAAGGTACAAATTGATTAACCTGACAAATCACCTGATTTACGTTGACTTTCCCACTGG
TGCACCTAATACTTGGTTTGGTAGTGG

Last Updated on 06.12.2018 16:11