Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 263D09 and hit At2g24625 are shown.
Line ID 263D09
Locus At2g24625 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr2:10469181
Primers used for PCR 32pv - 8474, show primer details
   
Sequence Name 30-K115371-0022-263-D09C-32pv
GenBank Accession LN499851 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 32pv: 5'-AGGGATACATGTCAAAAGGAGAGA-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>30-K115371-0022-263-D09C-32pv
GTACGAGGAAACTTACTTTATATATTAGATATTGAGATTATATAAGCCTCAAGAATTTGA
TGATGGACCTCATCTTAGGTATTTTTCACCTTTAGAAAATTATTAGCTAACTCAATGTAC
TTATTATTGTATATGCTCATATTTTAACTTAAGACTCCAAAAAATTTGAAAAGAAATCCC
AAACGAATTTCTTTTTAAAAACAAAAAACTAATTTTATCAAAAATAAGAAATATATAAAA
ACAAAATGAAATTAGCATTAAAAAAAAGATAATAATAAATGTACCATTAATATTTAGAAT
ATAAACATATCAATAAATATTTAGAATATATGATATAAAGTTTACATTAATTATTAAGTG
TACACGTATTAGATGCTAGAGTGATAACGTGTGACACGTATGGTAAAAATTGGCCAATTT
ATTACAGAATTAATAATTATGGGTTTAAGCTCGACATGCGGATCCATTATCGTAATGGTA
GCAGTAGCAATCTAAATTTGTCGTCTTTGGAAGTATTAGACATTTTCCATTAACATACTT
TTCTATTGTCCAACATGTCTTTTCAATTGTAAATGGCTTCATGTCCGGGAAATCTACATG
GATCAGCAATGAGTATGATGGTCAATATGGAGAAAAAGAAAGAGTAATTACCAATTTTTT
TTCAATTCAAAAATGTAGATTC
   
Sequence Name 10-K115370-0022-263-D09C-8409
GenBank Accession LN490790 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>10-K115370-0022-263-D09C-8409
GACAATAGAAAAGTATGTTAATGGAAAATGTCTAATACTTCCAAAGACGACAAATTTAGA
TTGCTACTGCTACCATTACGATAATGGATCCGCATGTCGAGCTTAAACCCATAATTATTA
ATTCTGTAATAAATTGGCCAATTTTTACCATACGTGTCACACGTTATCACTCTAGCATCT
AATACGTGTACACTTAATAATTAATGTAAACTTTATATCATATATTCTAAATATTTATTG
ATATGTTTATATTCTAAATATTAATGGTACATTTATTATTATCTTTTTTTTAATGCTAAT
TTCATTTTGTTTTTATATATTTCTTATTTTTGATAAAATTAGTTTTTTGTTTTTAAAAAG
AAATTCGTTTGGGATTTCTTTTCAAATTTTTTGGAGTCTTAAGTTAAAATATGAGCATAT
ACAATAATAAGTACATTGAGTTAGCTAATAATTTTCTAAAGGTGAAAAATACCTAAGATG
AGGTCCATCATCAAATTCTTGAGGCTTATATAATCTCAATATCTAATATAATAAAGTAAG
TTTTCCTCGTAACTTATGATTTAAAAATTTGACACGTGACATCTCTCCTTTT

Last Updated on 06.12.2018 16:11