Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 316D12 and hit At1g18620 are shown.
Line ID 316D12
Locus At1g18620 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr1:6410844
Primers used for PCR 15dl - 8474, show primer details
   
Sequence Name 54-K112131-0022-316-D12C-15dl
GenBank Accession LN508523 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 15dl: 5'-GATGAACACGATGATGAGAAAGAA-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>54-K112131-0022-316-D12C-15dl
GCTCATCCATTACTGCTAACAAGGTTTGAGTCCTGACACTGAAATGCTGATCTTTGCTGA
CAAATTGCATCAACAGAGTCTCTTTCAAAGTTGATACTATTGACATGTGCATTACCTGCA
AAAAAAAAAAAAACCCCCCAAAATTTTTTTTTCCCAAAAACCCCCCAAAAATTTAAAAAT
TTTTAAAACTTCAAAATTTTAAAGGTTAAAAAAATCCAAAACCCCCCAAAAAAAAAACCC
CCAAAAAACCCAAAATCTTTTTAAAAAAACTAAAAAAATTTTCAAAAATCAAAAAAAATT
CCCCCAAAAAAGGAAAACCTTTTTTTTCCCCCCCAAAAAAATCAAAAAAACCCTTTTTTT
TTTAAAAAAAACCCCCCCTAAAAAAAAAAAAAATTTTTAAAAAAACTCCTTTTTAAAAAC
TTTTTACCCCAATTCCCCTTTTCCAATTCCCCCCCAAAAAAACCCCTTTTAAACCTTTAA
CCCTTTTTTTTTCCTTAAGTTTTTTGGAATTAAAATCCCCCAAAAAAAAACCCGGAAAAT
TTTTTTCCCGGAAAATTTCCATTTTAAAAGGGCTCCCTTCCCGGAAAATCCCCCGGGAAC
CCCCATGAATTAAAGGGCCAATTTGGAAAAAAAAAAAAAATTTTTCCCATTTTTTTTTCA
TTTCAAAAATTAAA
   
Sequence Name 38-K112130-0022-316-D12C-8409
GenBank Accession LN503029 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>38-K112130-0022-316-D12C-8409
TATCCTGGAATACATTTCCCGGATCTTACTTTAGGTAATCATAATCCAATAACACTTAAG
TAATAAATAATGCTTAATGCTCTAGATCGTGTCTCTTAGTCGTTGACTTGTACATGGCTA
TATGGGTTACAACGTTCTTAATATGTATGTCTTTTACAATCTTTCTTCTTCTTTAGCTCG
GTTTCTTCATGAACTATAAAGGTCTTGTCTGATTCTTCTGTGGTGACTAGAAAGGTTTGT
CCTTTCTTGGCTGAATCTTATCTGATTTGTGAAATGTCTGTTAGTTTTGTTAAATTGATT
TTGAGTTTTATGTTGCTTTTTTTCTTGGTAGCTTTTGACTTCTCTTAACCTTAAGACTAT
TGAAGTTTCAAGAATCTGTAATGTTTAGGGGGTTTATTGGCAAAGATAATTTTGTTGATG
TTTTTTTTTTTTTTGGGGGGAAGGCCCTTTCCAAAAATTCCCCTTTTAAAAAAAACCTTT
TTAAACAATTTTTTCCCAAAAAAAAAACTTTTTGGGTGCGGGACCAAAACCTTTTTTCCC
TTAAGGGTTTGGGCAAAAAATTAAAGGGGTTTTCCCCCAAAGGTTCGGGGGTTTTTTTC

Last Updated on 06.12.2018 16:11