Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 374G11 and hit At1g66570 are shown.
Line ID 374G11
Locus At1g66570 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr1:24835646
Primers used for PCR 70us - 8474, show primer details
   
Sequence Name 36-K117403-0022-374-G11C-70us
GenBank Accession LN502384 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 70us: 5'-AATGTAGTATATATATGAGACTAG-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>36-K117403-0022-374-G11C-70us
ATTTTCTAAACGTCCACAATAAAAAATGTTTTATATTTCATTTGTGCTATTTTTGAAACA
TTGGGAATGATGTGCTAAATTTGGGAAACTTTTTTATGCAGCATAACTTATGCTGTTTGT
TAAAATTGCTATAATTTTAAATTAATTTTAATAATTTAACAGAATAAAGTTTAAATTAAT
TTTAAGTATACAAGAGTCCTTACCTAGTGCTACAATAATATTAAAAAATGCATATATAAT
AAATAAAACGCATAAACTTTTTAAGGTAAAACGGTAAATGCCACAATACTGCTGACTGCC
GCTGCAATAGCTCCGACCACAAATCCTGGTAAGTTTCCATCTCCAAATAACGCATCAATA
GGACCAACTCCAAACGATACAATCATTTGTGGTATGACAATTGCCATGTTTAAAACTCCT
AGAGAAAGTCCTGCAAAGATGACAACAAAAAAGACACATCATTATTAATTTGATTTTTTA
ATATTTATATTACACAAAATAATTGTTGTTGTTTTTATTGATAAATTTATGGTAAATTCC
TTGTGGTGAATAAAAACCAATTCCGTAAGAATATCAATTCATCAATATTCAATCTAATAT
TCATCAATATTCAATTGTAAATGGCTTCATGTCCGGGAAATCTACATGGATCAGCAATGA
GTATGATGGTCAATATGGAGAAAAAGAAAGAGTAATTACCAATTTTTTTTCAATTCAAAA
ATGTAGATGTCCGCA
   
Sequence Name 12-K117402-0022-374-G11C-8409
GenBank Accession LN491767 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>12-K117402-0022-374-G11C-8409
ATTGATGAATATTAGATTGAATATTGATGAATTGATATTCTTACGGAATTGGTTTTTATT
CACCACAAGGAATTTACCATAAATTTATCAATAAAAACAACAACAATTATTTTGTGTAAT
ATAAATATTAAAAAATCAAATTAATAATGATGTGTCTTTTTTGTTGTCATCTTTGCAGGA
CTTTCTCTAGGAGTTTTAAACATGGCAATTGTCATACCACAAATGATTGTATCGTTTGGA
GTTGGTCCTATTGATGCGTTATTTGGAGATGGAAACTTACCAGGATTTGTGGTCGGAGCT
ATTGCAGCGGCAGTCAGCAGTATTGTGGCATTTACCGTTTTACCTTAAAAAGTTTATGCG
TTTTATTTATTATATATGCATTTTTTAATATTATTGTAGCACTAGGTAAGGACTCTTGTA
TACTTAAAATTAATTTAAACTTTATTCTGTTAAATTATTAAAATTAATTTAAAATTATAG
CAATTTTAACAAACAGCATAAGTTATGCTGCATAAAAAAGTTTCCCAAATTTAGCACATC
ATTCCCAATGTTTCAAAAATAGCACAAATGAAATATAAAACATTTTTTTATTGTGGACGT
TTTATGAAAATATCATATTCGCCTAAAGATAAAAAGCTAGTCTCATATAANACCTACATT

Last Updated on 06.12.2018 16:11