Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 429E04 and hit At4g39640 are shown.
Line ID 429E04
Locus At4g39640 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr4:18402830
Primers used for PCR 13iv - 8474, show primer details
   
Sequence Name 71-K113020-0022-429-E04C-13iv
GenBank Accession LN512586 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 13iv: 5'-TGTAAAACCCTTTCCAAAATGAAG-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>71-K113020-0022-429-E04C-13iv
GTTGTACTCTTAAGAAATTTCCTCTATTGTTGGTCAATGTTTTAAATGTTCCTTAAATGT
TTAACTTCTAATAATTAGTTATCTATCTTTTTTTTTTAAAAAAACCTTAAAAAAAAAAAT
TTAAATTGAAAAAAATGGATTTAACCTGGAAAAAATGGAATTAAAAAACCTATGGGAAAC
GGTTGCCCCCTTGCCCAAAATGGACCCCTAAAGGCTAATTTTGGCTGGTAAAAAATTTCC
ATAAATTTACCTAACCCCTATCCAAAACCCCCTCCAATATAAAACCGGTATACCCCATTT
TATGGATCCGAAAATCCAGGCTAAACCATCCGGGTGGCTTATAACCTCCGAAATCCGGAG
GGGTAATTTGGGTAACCCTTGGCAGGAAGGACTACCTAGGAGGCCAACCCCGGAGTATGA
AAAAAAATGGGCCCAAATTTGGGTTACCCAAGGCACCAAGTTTGGATAGGGAAATAAAAA
TATTTCCTCCCCAAAGTCCGGTCCATTATCCAAGGAACCATTAAAACCTTAAAATAATCC
CCGACCTAAAATCCCCAATACCCGGAAGGGACCCCCCCTTTCCAAGGACCACAAACGGAA
AAGGGCTCCAGGCCCGGAAAACCTCCTGGGACCACCAAGGAGTATGAGGGCCAATAGGGA
GAAAAAGAAAGAGTATTTCCCATTTTTTTTCCATTCCAAAAAGGAAAATGCCCC
   
Sequence Name 39-K113019-0022-429-E04C-8409
GenBank Accession LN503413 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>39-K113019-0022-429-E04C-8409
CTCGAAAAGGAGGGTTCCCTTCAGGATATTGAGAATCTTATATCGAGATTTATTTTATGT
TTTTATTGTTTCTTTGATTATTGAACCGAACTTTGTGATGAATATATTTTTATTTCACTA
TCAAAACTCGTTGCATTGGCTAACCAAAATCTGGACCAATTTATTATCATACTCAGGGTT
AGGCCTCCTAGCTAGTCCTACATGCAATGGCTAACCAAAATAACACATCAGAATTCAGAA
GATAATAAGCAACCAGAATGATTAAGCATGAATTTCAGAATCAATAAAATGGGATATACA
GATTCTATATTGATGTGTATTTTGTATAGAGTTTAGCTAAATTAATGAAAATTATTAACA
AGCAAAAATAAGCATTAAGAGATCAATTTAGTGCAAGTGGACAACTGTTACCTATAGATT
TTTAAATACAATTTATACAAGATAAAATCAATTATTCTCAATTAAAATTTTTATTTTAAA
GATTTCTTAAAAAAAAAAAGATAGATACCTATTTTTTAAAGTTTAAACTTTTAAAAAACT
TTTAAAACTTTGACCAACAATAGAGGGAATTTTCTTTAAAAGTTACAACTTTGGGAAAGG
GTTTTATATTCATAATTTCCCTCCATTTGGAAAAGGGTTTTACA

Last Updated on 06.12.2018 16:11