Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 726D06 and hit At1g23670 are shown.
Line ID 726D06
Locus At1g23670 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr1:8374536
Primers used for PCR CR53 - 8474, show primer details
   
Sequence Name 37-K107201-0022-726-D06C-CR53
GenBank Accession LN502635 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, CR53: 5'-TTGGATTTTGTTCTGTGGTATTCA-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>37-K107201-0022-726-D06C-CR53
CATCTTCTAACTTTATATGATCTGATTGAATCTAAACCGTTCAATAAAATTAATTCCCTT
CAATCTAAACCGTTCAACAAAAATAAGTGAAATAATGTTATTTTTTTATCTTTACTTTAA
AGACATATAATTATAAATAACATAATTAATATAGTCTTTATTTTGCCAAAAAAGTGTATA
ACCTGTCAAATAGTTAAAAAAACACTTATAATCATAAACAATTTTATACCAATTTTGTGA
ATCTTACATTTTTGTAAATATTTTACTTTCACTAAAATTACATACACATTTTTAAACACA
TTTTAACACATTTCTCTTATCACTAAATAACAACCAAAAAAATCCCAATTATTATTTAGT
TATGTTTGATTAAAAAGTTTATATTTATAAATTTAAGATATCAAATTCATTCAAATATTT
AGTATAAGAACCAAATAAACCGATTGCCCGCGGTAAACCGCGGGTTAAATCCTAGTTTAT
TGTGAAAGCCCGTTACAATATGGCTTCATGTCCGGGAAATCTACATGGATCAGCAATGAG
TATGATGGTCAATATGGAGAAAAAGAAAGAGTAATTACCAATTTTTTTTCAATTCAAAAA
TGTAGATGTCCGCACGNTTATTAT
   
Sequence Name 33-K107200-0022-726-D06C-8409
GenBank Accession LN501021 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>33-K107200-0022-726-D06C-8409
CGGGCTTTCACAATAAACTAGGATTTAACCCGCGGTTTACCGCTGGCAATCGGTTTATTT
GGTTCTTATACTAAATATTTGAATGAATTTGATATCTTAAATTTATAAATATAAACTTTT
TAATCAAACATAACTAAATAATAATTGGGATTTTTTTGGTTGTTATTTAGTGATAAGAGA
AATGTGTTAAAATGTGTTTAAAAATGTGTATGTAATTTTAGTGAAAGTAAAATATTTACA
AAAATGTAAGATTCACAAAATTGGTATAAAATTGTTTATGATTATAAGTGTTTTTTTAAC
TATTTGACAGGTTATACACTTTTTTGGCAAAATAAAGACTATATTAATTATGTTATTTAT
AATTATATGTCTTTAAAGTAAAGATAAAAAAATAACATTATTTCACTTATTTTTGTTGAA
CGGTTTAGATTGAAGGGAATTAATTTTATTGAACGGTTTAGATTCAATCAGATCATATAA
AGTTTAGAAGATTGTTAAGACCAAATTACCCTTAATGATTTTGAATACCACAGAACAAAA
TCCA

Last Updated on 06.12.2018 16:11