Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 895D12 and hit At3g53420 are shown.
Line ID 895D12
Locus At3g53420 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr3:19805162
Primers used for PCR MF13 - 8474, show primer details
   
Sequence Name 31-K031754-022-895-D12C-8409
GenBank Accession LN500043 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>31-K031754-022-895-D12C-8409
CCATTTACAATTGAATATTTCCCGCCGGTATCTCTGGTATGATCCTTCTTTAATCTTGAT
TTTGGTTTGGTTTAGATTAAGATTATACACTTTTTGAGTATTAGAATTACAATTAAACCG
AATAAGCTGAATAAGTTTTACTTATGTAAGTACAACTTGCAAACTCAAAATTTAGACAAG
TAAAAATTATATGGTATGGTTTTGGTTTGTTTATTCGAAATTAATTATTTTGCAAGGAAA
AATATTGCTTGGTTGACATTACTATTTAATCGGTTTAAAATCTTAGGTTTAAAAGACGAA
AATGATTTGTTTATAAAACATTTAATAAGGGTCATGATCAAATCGGTTCTTATCCGAATG
ATATATATCTAATCTAAGCCTAGTAATTATTTTAAGCAACTGACTAACCCTGTCTTAACC
AGAATTGAAACCGGTTAATTAATTGCTTGTTGTACCTTAATTCTCAAGTACTGGTAACAT
TGTCAACTCTTTTTGTTTCCTTAGGTGGTCACATTAAC
   
Sequence Name 32-K031754-022-895-D12C-MF13
GenBank Accession LN500464 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, MF13: 5'-GGTTAATGTGACCACCTAAGGAAA-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>32-K031754-022-895-D12C-MF13
GGTACAACAAGCAATTAATTAACCGGGTTTCAATTCTGGTTAAGACAGGGTTAGTCAGTT
GCTTAAAATAATTACTAGGCTTAGATTAGATATATATCATTCGGATAAGAACCGATTTGA
TCATGACCCTTATTAAATGTTTTATAAACAAATCATTTTCGTCTTTTAAACCTAAGATTT
TAAACCGATTAAATAGTAATGTCAACCAAGCAATATTTTTCCTTGCAAAATAATTAATTT
CGAATAAACAAACCAAAACCATACCATATAATTTTTACTTGTCTAAATTTTGAGTTTGCA
AGTTGTACTTACATAAGTAAAACTTATTCAGCTTATTCGGTTTAATTGTAATTCTAATAC
TCAAAAAGTGTATAATCTTAATCTAAACCAAACCAAAATCAAGATTAAAGAAGGATCATA
CCAGAGATACCGGCGGGAAATATTCAATTGTAAATGGCTTCATGTCCGGGAAATCTACAT
GGATCAGCAATGAGTATGATGGTCAATATGGAGAAAAAGAAAGAGTAATTACCAATTTTT
TTTCAATTCAAAAATGTAGATGTCCGCAGCGTTATTATAAAATGAAAGTACATTTTGATA
AAACGACAAATTACGATCCGTCGTATTTATAGGCGAAAGCAATAAACAAATTATTCTAAT
TCGGAAATCTTTATTTCGACGTGTCTACATTCACTCCCAAATGGG

Last Updated on 06.12.2018 16:11