Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 925D09 and hit At1g26300 are shown.
Line ID 925D09
Locus At1g26300 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr1:9096969
Primers used for PCR 59wj - 8474, show primer details
   
Sequence Name 87-K118544-0022-925-D09C-59wj
GenBank Accession LN514804 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 59wj: 5'-ATTAATTGCCAAAAAGCAAGTGTC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>87-K118544-0022-925-D09C-59wj
CCATATTGAACCAGAACATCTCTTAGGGGTTTGGATATTGTATCCAATTAATTTACACAA
AAATTTTAAAATTAACACTTATCAAAAAAACAAAAAAATTTAAGAAAAAAAACAAGTGTT
AAAAATTTAATTATGTGTAAACCATATTGAACCTAAGACACCTCTTAGGAGCTTGGATGT
TGTGTGTCCAATTAATTCACACAAAAATTAAAACTTAAAAGTGTTAAAAATTTAATTATG
TGAAAATCATATTGAACTTTCTCTTAAGGGATTGGATAGTGTGTTCAATTAATTTACAAA
AACTTAGAAACTTAACACTTATAAGTAAAAAACATTTTGGTTGCAAACTAAATTATTTGA
TTCTTATTCTTAATCAGTTACCATGTCTTAATACACCGATAGCATTTCTTTGCTAAATTT
TCTCCTAATCATATTATTGCTAAGAAAAAAAACTAATTGGATTTTAGGATTTAATGTTAT
TTTGTAAATGGATATATTCAATTGTAAATGGCTTCATGTCCGGGAAATCTACATGGATCA
GCAATGAGTATGATGGTCAATATGGAGAAAAAGAAAGAGTAATTACCAATTTTTTTTCAA
TTCAAAAATGT
   
Sequence Name 67-K118543-0022-925-D09C-8409
GenBank Accession LN511907 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>67-K118543-0022-925-D09C-8409
CCTTTACATTGAAATATCCATTTACAAAATAACATTAAATCCTAAAATCCAATTAGTTTT
TTTTCTTAGCAATAATATGATTAGGAGAAAATTTAGCAAAGAAATGCTATCGGTGTATTA
AGACATGGTAACTGATTAAGAATAAGAATCAAATAATTTAGTTTGCAACCAAAATGTTTT
TTACTTATAAGTGTTAAGTTTCTAAGTTTTTGTAAATTAATTGAACACACTATCCAATCC
CTTAAGAGAAAGTTCAATATGATTTTCACATAATTAAATTTTTAACACTTTTAAGTTTTA
ATTTTTGTGTGAATTAATTGGACACACAACATCCAAGCTCCTAAGAGGTGTCTTAGGTTC
AATATGGTTTACACATAATTAAATTTTTAACACTTGTTTTTTTTCTTAAATTTTTTTGTT
TTTTTGATAAGTGTTAATTTTAAAATTTTTGTGTAAATTAATTGGATACAATATCCAAAC
CCCTAAGAGATGTTCTAGGTTCAATATGGTTTACAAATAATTAAATTTTTGACACTTG

Last Updated on 06.12.2018 16:11