Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line SALK_099663c and hit At4g02380 are shown.
Line ID SALK_099663c
Locus At4g02380 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr4:1046515
Primers used for PCR 92by - LBb3, show primer details
   
Sequence Name 60-K108702-SALK_099663C-92by
GenBank Accession LN485735 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 92by: 5'-GTCGAAACTCCAGAGGTACAAAAC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>60-K108702-SALK_099663C-92by
AGTTATTAACTACTTATTAAATGATTTCTATGTCAAGTACCTGTTGCTAAATGCACTGCC
ACTAATTATAATCTATTACTACTAACAATTAGTAGTAACCAAGAGTCAAGAGACATGATT
CTGTCGGTTATATCCATGCAAGGAACAAAACCATATAATTAAGAAGCTTTATATGTTGAT
CCACTACCATGAATTCCTAATGCTTATCTATGCTTATGCTATATGCCAATATTTTTTAAA
AGTCCAATTGTTCATCATTACATTCCTTTTAATACGTTATCTCATACGTTAATTAGATTA
TAATTATAAAAAACACACATACGATATTTGAACATTTTCGTATGCCAATCAAATTGGAAC
GATACAAAGAAAATTATCATACCTACTCATCACCTATAGTTACATTATGATTCTGAATCA
AAATAACCAATAATGGTTTTGTCATATAGGACGTTTGTACAAACGTTAAGCAATAAATTT
ATCATACAGAATTCTATAATCAGAATTCTGTAATCAGTTAAGAAGTTCTGAAATGGTTTT
ATAAGAAAAACTCTATCATACATCCAACGATCCTTTTGTTACAATTAGAGGAAACCAAAC
GCTTCTCTATTTTATTCATTACAGAACCGCACTTAACATATGAAAATAGGGTTCACTGCA
CCAGATCATTACCCACTAATCTCCTCTTAAAGACCTTGACAAAATTACATGTAATAATAA
TCAATCACTGCTTGTTGTTCAAGAGAGCTGCTCGTAGCTCAGCCGCGTCAATCTCGTTGG
AACCGGTTTCGGGTCTGTAATAACCGGTTTTGGGATCTGGAACCCAGGATATATTGTGGT
GTAAACAAATTGACGCTTAGACAACTTAATACACATTGCGGACGTTTTTAATGTACTGGG
   
Sequence Name 52-K108701-SALK_099663C-R210
GenBank Accession LN485553 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, R210: 5'-CCCAGTACATTAAAAACGTCCGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>52-K108701-SALK_099663C-R210
GTCATTTGTTTCCCACAATATATCCTGGGTTCCAGATCCCAAAACCGGTTATTACAGACC
CGAAACCGGTTCCAACGAGATTGACGCGGCTGAGCTACGAGCAGCTCTCTTGAACAACAA
GCAGTGATTGATTATTATTACATGTAATTTTGTCAAGGTCTTTAAGAGGAGATTAGTGGG
TAATGATCTGGTGCAGTGAACCCTATTTTCATATGTTAAGTGCGGTTCTGTAATGAATAA
AATAGAGAAGCGTTTGGTTTCCTCTAATTGTAACAAAAGGATCGTTGGATGTATGATAGA
GTTTTTCTTATAAAACCATTTCAGAACTTCTTAACTGATTACAGAATTCTGATTATAGAA
TTCTGTATGATAAATTTATTGCTTAACGTTTGTACAAACGTCCTATATGACAAAACCATT
ATTGGTTATTTTGATTCAGAATCATAATGTAACTATAGGTGATGAGTAGGTATGATAATT
TTCTTTGTATCGTTCCAATTTGATTGGCATACGAAAATGTTCAAATATCGTATGTGTGTT
TTTTATAATTATAATCTAATTAACGTATGAGATAACGTATTAAAAGGAATGTAATGATGA
ACAATTGGACTTTTAAAAAATATTGGCATATAGCATAAGCATAGATAAGCATTAGGAATT
CATGGTAGTGGATCAACATATAAAGCTTCTTAATTATATGGTTTTGTTCCTTGCATGGAT
ATAACCGACAGAATCATGTCTCTTGACTCTTGGTTACTACTAATTGTTAGTAGTAATAGA
TTATAATTAGTGGCAGTGCATTTAGCAACAGGTACTTGACATAGAAATCATTTAATAATG
TAGTTAATTAACTTAAATCAGTTTTTAAGACATGTTTTGTACTCT

Last Updated on 06.12.2018 16:11