Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 907G01 and hit At1g49820 are shown.
Line ID 907G01
Locus At1g49820 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr1:18442873
Primers used for PCR AB52 - 8474, show primer details
   
Sequence Name 66-K103849-0022-907-G01C-AB52
GenBank Accession LN511595 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, AB52: 5'-CTCCTCGAAGATGATCAACACATA-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>66-K103849-0022-907-G01C-AB52
TCAACATGCCTAACAATATTTTGTATCATGATGTGGTATATTCAATAGCTACAAAATATT
TTTCTGAATCGTTATGTTGTATGTTTCTCTATAGCCAAGGTTTTGGAGAGATAATCTGAT
AGATTATATTTCTTCAACAAAATTATTGACATGTCTGTTGTTTACTGATTTCTTTAGCTT
TTAATAAATAATTTTTTTAACTAAAGCAAGAACAAATATCCNAAAATATAGATGTAAATC
AAATTTTACATATTAAAGTATATGCAAAAAAGAACCAATGAATTTCATAGTTTTATTTTC
AAAGCTAAAATTTAATCGAAAATTAAATTAAATCTTTTCAAATATCCNATTAAATAAAAT
AAAGTTTTGTCTATTCAATTAAAATTTAGTATTGAAATACCTTTTCTCTTGATTATGATA
TTTATTCTGAAAATTTGTACCAAAAGCCTATCANATGGATTTAAACTCAAATAAGGCAAG
TTATTTAAAAGGGGAAAAAAAAATTAAGTTCTTAACCAGAAAACCTGAACTAAACTGAAT
CAATATTAGGTGGGTTTCTTTGGTTTCGATTAAACCGAANTTAATGAATTTGGTTTGCAA
AACACTGACAAGATTATTGTCGAATATNANAGAAGGCGTGATTGTTATCAGGATATATTC
AATTGTAAATGGCTTCATGTCCGGGAAATCTACNTGGATCAGCAATGAGTATGATGGTCA
ATATGGAGAANAAGAAAGAGTAATTACCAATTTTTTTTCANTTCNNAAATGTA
   
Sequence Name 82-K103850-0022-907-G01C-8409
GenBank Accession LN514185 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>82-K103850-0022-907-G01C-8409
ATCGGAATGAGCCATTTACATTGAATATATCCTGATAACAATCACGCCTTCTATTATATT
CGACAATAATCTCGTCAGTGTTTTGCAAACCAAATTCATTAATTTCGGTTTAATCGAAAC
CAAAGAAACCCACCTAATATTGATTCAGTTTAGTTCAGGTTTTCTGGTTAAGAACTTAAT
TTTTTTTTCCCCTTTTAAATAACTTGCCTTATTTGAGTTTAAATCCATATGATAGGCTTT
TGGTACAAATTTTCAGAATAAATATCATAATCAAGAGAAAAGGTATTTCAATACTAAATT
TTAATTGAATAGACAAAACTTTATTTTATTTAATTGGATATTTGAAAAGATTTAATTTAA
TTTTCGATTAAATTTTAGCTTTGAAAATAAAACTATGAAATTCATTGGTTCTTTTTTGCA
TATACTTTAATATGTAAAATTTGATTTACATCTATNTTTTTGGATATTTGTTCTTGCTTT
AGTTAAAAAAATTATTTATTAAAAGCTAAAGAAATCAGTAAACAACAGACATGTCAATAA
TTTTGTTGAAGAAATATAATCTATCAAATTATCTCTCCAAAACCTTGGCTATNGAGAAAC
ATACAACATAACGATTCAAAAAAATATTTTGTAGCTNTTTGAATATACCACATCAGGATA
CAAAATATTGTTATGGCATTGTTGTTTGGAATAGGATATGTGTTG

Last Updated on 06.12.2018 16:11