Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 086E06 and hit At3g45470 are shown.
Line ID 086E06
Locus At3g45470 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr3:16680710
Primers used for PCR DR72 - 8474, show primer details
   
Sequence Name 51-K035533-022-086-E06C-DR72
GenBank Accession LN507421 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, DR72: 5'-GCCTAAGGTTTAATGACTCGACAC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>51-K035533-022-086-E06C-DR72
TCAGAAGCGGCTCCTAGCTCGTTCGTGTGATTAAACTAATTAACTTTATATATTAAAAGG
GAACTAAGAGAAATTAAAAAAGAAAGAGCCCTATGCAAAAAAAAGAAAATTAAACTTTTA
TCAAATTAAGGAATATTTTTTCATATATATCAAAAAAGTAAATTAAAATTAAAAAACCTA
AACAAAAACGATAGGGAAAAGTAATGTTATCGGAAAAGTAGTACTATTAAAAAAAAAAAA
AAGTATTTTTGTTGATCTCTAAACCTCAAAAAAAACAAAAAATTGAAAAAAAAGTGTTTC
AAAACAACTATGGATATTCCCCAAATACAACCAGTCCCCCAGGAGCATACAAATCACCCC
AATCATCTTCATTCCCCATCAAAAAAATAACCTTGGCCAGTACGTGAACAACCAGTAGGA
CAAGTCACTTGACCCTTCTTCCATTCAACTCCCCATTTGTAGCAAAATTGATACCCACAT
CTACAAAGGCCACAACAACTTTACAATAAAACAAAAACTTTTTGTCTCTGGTTATGTCTA
AATTGAGTTAAATATGTATAAAATGTACCTGCAATTGTAAATGGCTTCATGTCCGGGAAA
TCTACATGGATCACCAATGAGTATAATGGTCAATATGGAAAAAAAAAAAGAGTAATTACC
AATTTTTTTTCAATTCAAAAATGTAAATTTC
   
Sequence Name 03-K035533-022-086-E06C-8409
GenBank Accession LN487387 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>03-K035533-022-086-E06C-8409
GAGCCATTTACAATTGCAGGTACATATAATACATATTTAACTCAATTAAGACATAACTAG
AGACAAAACGTTTATGTTTTATTGTAATGTCGTTGTGGCCTTTGTAGATGTGGGTATCAA
TTTTGCTACAAATGTGGAGTTGAATGGAAGAAGGGTCAAGTGACTTGTCCTACTGGTTGT
CCACGTACTGGCCAAGGTTATTTTTATGATGGTGAATGAAGATGATTGGGATGATTTGTA
TGCTCATGGTGGACTGGTCGTATATGCTGAATATCCATAGTTGTTATGAAACACTCTTTT
CTCAATTCTTTGTATCTTATGAGGTCTAGAGATCAACAAAAATACTTTTTTTTTTTTTTA
AAATTACTACTTTTCCAAAAACATTACTTTTCCCTATCGTTTTTGTTTAGGTTTTTTAAT
TTTAATTTACTTTTTTGATATAAAAAAAAAAATATTCCTTAATTTAATAAAATTTTAATT
TTCTTTTTTTTGCAAAGGGCTCTTTCTTTTTTAATTTCCCTAATTTCCCTTTTAATTAAA
AAGTTAATTATTTTAATCCCACAAACAACCTAGGACCCCCTTCTAATATATAATCTATAA
AACCTAAAATTGTATGTGTCGAGTCATTAACCCTTA

Last Updated on 06.12.2018 16:11