Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 957G01 and hit MLM24 are shown.
Line ID 957G01
Locus MLM24 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr3:8397081
Primers used for PCR KD86 - 8474, show primer details
   
Sequence Name 40-K103307-0022-957-G01C-8409
GenBank Accession LN503676 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>40-K103307-0022-957-G01C-8409
ATTCGGATGAGCCTTTACATTGAATATATCCTGATTTTACATGAATATAGCAAATTTACT
TAACATGATTTGTATCATACTTTTTACTTAATATGATTTTAAGAACATGCTAGTTACCAT
TTCTCAAAATCGTAAACTAATTTAATAGGTTCAACCCAAATAGGCAGGGTTTGATGTTTG
TAATTCATTTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGTAAAAAAAAATTCTTTTTTTTTTA
AAAAACCAAAAACTTCAAAAAAAATTTCAAAAAGGCAACCAATTTAATTCCCCCCCCCTT
TTTTTGTAAATTTGGGAAAACCGAAAAATTTGAACAACCTTGGGCTGGGGAAAAAAAAGC
AATTAATTAACACTCCTGGAATTTCCAAAAAGGAGGGAAAAATTTTGCCCCCAAAAACCT
TTTTTTTCCTTTAATTTAAAAATTTTATATTTTTTTTAAATTTCAAAAAACTAAAATCCT
TCCCATTGGAAGGTAATTTTTTTAATAACAATTCGGGGCACCAACTAAATTAACGGTTTT
TTAAAAAAAAAAAATTTTTAACCCTTTTTTAAAAAAAAATTTTCTAACCATTAAAGTTGG
GGGGTCGGGATTTAAACTTTAAGGGTAATCGTGGGGAAAA
   
Sequence Name 16-K103308-0022-957-G01C-KD86
GenBank Accession LN493394 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, KD86: 5'-TCTCCCAATCGATTACCTTGATAG-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>16-K103308-0022-957-G01C-KD86
ACTTTATTGCTAGAAACTCATTTTTGAATAGCGTTGATAACTCTTTTTTTTTCGAAAGCA
GTAAATTATGTAGTAGCCCTGAATGCTAATTAGAGATATTACTGTCAAATGGTATGTATA
TGAGTATTATGAAATGATATATAGATATAAAATTATAAACTAAAAGAATATATAGCGTCA
TAGGCGCATAAATTCTCCTCTCATTATTGCATATCCAAGTAGTGTTAATTACTCGCTCAT
CTTCCACGAGCCACAGCTTGTCCAAATTCTACGGTTTCCCAACATTCACAAATAAAGGTG
CGAGAAGTTATATAGGTCGCATTTATGAAATTTTATATGATGTATTTGGTTCATAAGAAG
AAAATGAATGTTGTTCAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGATTTACAAACT
TCAACCCCGGCCTTTTTGGGTGAAACCTTTAAATTTATTTAACAATTTTAAAAAAGGGTA
ACTGGCAGGTTTTAAAATTCATTTAAGTTAAAAGGTAGAAACCAATTCGGGTTAGGTAAT
TTGGCTTTTTCCGGGTAAAAATCAGGAAATTTCCATTTGAAAAGGGCTCCATGCCCGGGA
AATCTCCGGGGATAACCATTGAGAAAAAGGGTAAATATGGAAAAAAAAAAGAAGTATTTC
CCATTTTTTTTCCATTTCAAAATTGTAATTTTCCCC

Last Updated on 06.12.2018 16:11