Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 903C05 and hit T32N15 are shown.
Line ID 903C05
Locus T32N15 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr3:16320989
Primers used for PCR 66zh - 8474, show primer details
   
Sequence Name 16-K125972-0022-903-C05C-66zh
GenBank Accession queueing for submission to ENA/GenBank
Sequencing primer gene specific primer, 66zh: 5'-GTATTCAAAAAGCACTAGATCGGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>16-K125972-0022-903-C05C-66zh
CCGCCTCGGGTTTTATCGAATTCCCACCTAGGAGGGTATATTTGTGCCGCCAAGTTGATA
CAACATTGCTACTTATGAGATTTTGGAAGAATGTGAACATGAAATAAAATGAGAAAAAGA
AAAATAATTAAAAAAAAAAATTTTTGGTATAATGAGAAGAAAAACATAGTAGAACAAATA
GCAAATATTAATGAAAAAATGAAAAACATAGTAGAACAAATAGCAAATATTAATGAAAGG
TCAATTTTTGTACATATCAAAATAATCACAAGTTGGTTCATTGTTCTTAATATACCTATA
AATATTTGATAGAAAAAGTTATTATCCTTATAACATGTTAAGAATATATGATAGGATGAC
TTAAATAAGGTTTGACACCTCTAAATATTTGAAAATGTAATTCTGCAAGCAATTTTTAAA
GTAATGAATGATGGGTTGTGCAAGCAATTTTTTCATTAGTATTATTATATAGTATAATAT
ATTTGATCATGCAAATAATTGCTAAATTCCGTAATTAACTAAAAAAAAAATCTCTTTTTA
ACACCCAAAGAATTAGAAATTGAAAATAAACTTCTTAAATTAACTCAACTTAATATTTAA
CTTTTTAATTAACTCAAAATAATCTACATTTTAAATGGGGCTCATTTATGATATTTTAAT
TTTTGATCTAACTGAATTATATGCAATCTTATTTTGTGGTTGTTAACATAAATTGAATAT
GGCTTCATGTCCGGGAAATCTACATGGATCACCAATGAGTATGATGGTCAATATGGAGAA
AAAGAAAGAGTAATTACCAATTTTTTTTCAATTCAAAAATGTAAA
   
Sequence Name 02-K125971-0022-903-C05C-8409
GenBank Accession queueing for submission to ENA/GenBank
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>02-K125971-0022-903-C05C-8409
ATTCATTTATGTTAACACCACAAAATAAGATTGCATATAATTCAGTTAGATCAAAAATTA
AAATATCATAAATGAGCCCCATCTAAAATGTAGATTATTTTGAGTTAATTAAAAAGTTAA
ATATTAAGTTGAGTTAATTTAAGAAGTTTATTTTCAATTTCTAATTCTTTGGTTGTTAAA
TAGAGATTTTTTTTTTAGTTAATTACGGAATTTAGCAATTATTTGCATGATCAAATATAT
TATACTATATAATAATACTAATGAAAAAATTGCTTGCACAACCCATCATTCATTACTTTA
AAAATTGCTTGCAGAATTACATTTTCAAATATTTAGAGGTGTCAAACCTTATTTAAGTCA
TCCTATCATATATTCTTAACATGTTATAAGGATAATAACTTTTTCTATCAAATATTTATA
GGTATATTAAGAACAATGAACCAACTTGTGATTATTTTGATATGTACAAAAATTGACCTT
TCATTAATATTTGCTATTTGTTCTACTATGTTTTTCATTTTTTCATTAATATTTGCTATT
TGTTCTACTATGTTTTTCTTCTCATTATACCAAAAATTTTTTTTTTTAATTATTTTTCTT
TTTCCCATTTAATTTCAGGTTCACATTCTTCCAAAATCTCAAAAGTAGCAATGTTGTATC
AACTTGGCGGCACAAATATACCCTCCTAGGTGGGAATTCGATAAAACCCGAGGCGGTGGA
AACTCTTTGCACCCATCGAAAGGCCAATCTAGTGCTTT

Last Updated on 06.12.2018 16:11