Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 083H10 and hit F25P17 are shown.
Line ID 083H10
Locus F25P17 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr2:10436069
Primers used for PCR ME08 - 8474, show primer details
   
Sequence Name 20-K027353-022-083-H10C-ME08
GenBank Accession LN495066 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, ME08: 5'-AGTTTTAAGCAGAACCCAAGAACA-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>20-K027353-022-083-H10C-ME08
ATTGGAAGCAAATAAAGGTGTTTTCGTTTATATATTTGTTTTAACCTTTAAAAGGAATCA
TGGAAGCAAATTGAAGACTCATTATAAGATTGTTCGTCTTGTTTGAGCGGTTGTAAAAAT
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AATTTTTGTAAATGGCTTCATGTCCGGGAAATCTACATGGATCAGCAATGAGTATGATGG
TCAATATGGAGAAAAAGAAAGAGTAATTACCAATTTTTTTTTCAATTCAAAAATGTAGAT
GTCCGCAGCGTTATTATAAAATGAAAGTACATTTTTGATAAACGACAAATT
   
Sequence Name 19-K027353-022-083-H10C-8409
GenBank Accession LN494615 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>19-K027353-022-083-H10C-8409
GCCATTTAAAAAATTATTTGTCTTCCACATCATAATGATTTCGTTGACCCTCAAATCCGC
ATTAATTCATATTGTTCAACCTCCACATCTAATATCTCCCAACAACTCATTGAAATCTCT
TTTTGACTTTCTATAAACTTACATAATAGTCAAACATTGCATTAACAACCCCATTCCAAA
AGTCTAACCCTCCATTAAATCAACGGGAAAAATGTCAATTAATCCCCTAACTTTTAAAAA
ATGGCCATTTTATACATCAATTTCGTATGCGGCCGTTTAAAACATGAACTAAAAGTTGAC
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TTGTGGTCATTTTAAACATCGACTTTATATGTGGCCATTTTAAACATGAACTAAGCGTTG
ATTACCATTTAAAACATGAGAAATTCGTTGACCAAGCCAAAATAAACATGTTGTCATCAT
TCATTAAAAGAACTTATAACATTCATTATCACTTGTTAACGACTCTATTAGTATCCCTAA
AACGACTTTGTTTTGAGAGTAATCAAAAGAAAATCAGGATTGTTTTCTAAATGAAACCCT
ACTTCCCCAAATCTATTTTTACAACCGCTCAAACAAGACGAACAATCTTATAATGAGTCT
TCAATTTGCTTCCATGATTCCTTTTAAAATTTAAAACAAATATATAAACGAAAACACCTT
TATTTGCTTCCAATTACTGGCACTGCGATTATCTCTTTATCAAACTATGTTCTTGG

Last Updated on 06.12.2018 16:11