Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 095A05 and hit At1g78980 are shown.
Line ID 095A05
Locus At1g78980 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr1:29710406
Primers used for PCR DC04 - 8474, show primer details
   
Sequence Name 24-K109234-0022-095-A05C-DC04
GenBank Accession LN497028 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, DC04: 5'-CAACACTAACTTTGGAAACCCATT-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>24-K109234-0022-095-A05C-DC04
GATGACGCANAGCTCGTACGCCTTGTGATCGTCTCTCTGGCTATTACTGTCACTTTACTT
CAAGCAAAAACCGATAACCAAGAAGGTAAAAACATTTACGGATTGAATTATTAAACGAAC
AGTTTTGATAGATTAATCAAATTAACCGATCAAGATATTAATCAGACAAGTTTTGACAGT
CTCCGCGTTGAACGTAATGTTCACGAGCTTAAATTCGCCGTCGAAACTCAAAGGTTGGAA
AGCTAACGGAGGTGATCCCTGCGAAGATTCTTGGGAAGGCGTCAAATGCAAAGGCTCTTC
GGTCACTGAATTGTATATAATCATTACCCTAATTTAATTACGAGCCATAGTCTCAAAAAC
TTACTTGTACCACAAGTCATCTTATATTCTTTCTTTTTTTCTCTGGCAGACAGTTATCAG
GCTTTGAGCTAGGTGGATCTCGCGGTTATCTACTAAGCAACCTCAAATCTCTCACAACTT
TGTGAGAATCCTCATTTAATAGTCTCGTTTAAATTAGTTAAACAAGTAATCAGAAAATAA
CAGTTTTGGTTTTTGAATATGGTGATAGTACAGTGATCTCAGCAAAAACAATCTCAAAGG
AAACATACCTTATCAACTCCCACCCAACATTGCCAATCTGTAAGTTCATACATTTGTTTG
TTTTTTTAATTACTTATTATGCAAGAAACAAATTGTAATCTGCTATTTGATATAGAGACT
TTTCTGAAAACGAACTCGATGGAAACGTGCCCTACTCGTTATCTCAAATGAAAAATCTCC
AAAGCATGTGAGTGAAAACAAAGAAATTGATTAAGCATATCTTTGCTGTGAATTATGGGT
TATGATCACTTGTTAA
   
Sequence Name 08-K109233-0022-095-A05C-8409
GenBank Accession LN489770 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>08-K109233-0022-095-A05C-8409
ATGTCCATAATTGAATAAATTAACAAGTGATCATAAACCATAATTCACAGCAAAGATATG
CTTAATCAATTTCTTTGTTTTCACTCACATGCTTTGGAGATTTTTCATTTGAGATAACGA
GTAGGGCACGTTTCCATCGAGTTCGTTTTCAGAAAAGTCTCTATATCAAATAGCAGATTA
CAATTTGTTTCTTGCATAATAAGTAATTAAAAAAACAAACAAATGTATGAACTTACAGAT
TGGCAATGTTGGGTGGGAGTTGATAAGGTATGTTTCCTTTGAGATTGTTTTTGCTGAGAT
CACTGTACTATCACCATATTCAAAAACCAAAACTGTTATTTTCTGATTACTTGTTTAACT
AATTTAAACGAGACTATTAAATGAGGATTCTCACAAAGTTGTGAGAGATTTGAGGTTGCT
TAGTAGATAACCGCGAGATCCACCTAGCTCAAAGCCTGATAACTGTCTGCCAGAGAAAAA
AAGAAAGAATATAAGATGACTTGTGGTACAAGTAAGTTTTTGAGACTATGGCTCGTAATT
AAATTAGGGTAATGATTATATACAATTCAGTGACCGAAGAGCCTTTGCATTTGACGCCTT
CCCAAGAATCTTCGCAGGGATCACCTCCGTTAGCTTTCCAACCTTTGAGTTTCGACGGCG
AATTTAAGCTCGTGAACATTACGTTCAACGCGGAGACTGTCAAAACTTGTCTGATTAATA
TCTGGATCGGTTAATTTGATTAATCTATCAAAACTGTTCGTTTAATAATTCAATCCGTAA
ATGTTTTTACCTTTCTTGGTTATCGGTTTTTGCTTGA

Last Updated on 06.12.2018 16:11