Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 112G11 and hit At5g54530 are shown.
Line ID 112G11
Locus At5g54530 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr5:22153207
Primers used for PCR 02ey - 8474, show primer details
   
Sequence Name 50-K111119-0022-112-G11C-02ey
GenBank Accession LN507206 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 02ey: 5'-TTCACTGTACCACTTCTATTCCCC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>50-K111119-0022-112-G11C-02ey
TCTTTTTGAAACGAACAATTTTGTATTAAATTCTACGGTTCGATCTGAAAAAAAAAACAA
ATGAATCTAAACGAATAATAGAGCGAAAACTGATATGGTCACATTGCTATTAGTCATAGT
CACTAATTTTTTTCTTTTTTGAAAATGTTTATTTTTGCAACAAACATTCAATCTAGAACT
TCGTAATGAAAAACTTAAATATTTGAAATTTATTGGGATAAAAAACAGTATTTATTAACA
CAAAAATGTATATTTCACATAACTAAATTAATTTAAAAGCCGACTAATTAGTTTAACCCA
TGGCAAAGGTAAAATGAGAAAACCGAAAATTAAGATGATAGAATCGTATATTTAGTCATC
AGGGAAATAAAATTTAAGAAAATCCAAACAACTATTCTTATCATAACAAACCAAAAAACA
GTTTAAAAACTAATTAATTAAACCAAAAAAATTGTTTTGTGTTAATCCAAAAAATTACCG
TCAGGATATATTCAATTGTAAATGGCTTCATGTCCGGGAAATCTACATGGATCAGCAATG
AGTATGATGGTCAATATGGAGAAAAAGAAAGAGTAATTACCAATTTTTTTTCAATTCAAA
AATGTAGATTC
   
Sequence Name 34-K111118-0022-112-G11C-8409
GenBank Accession LN501459 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>34-K111118-0022-112-G11C-8409
TTACATTGAATATTCCTGACGGTAATTTTTTGGATTACACAAAACAATTTTTTTGGTTTA
ATTAATTAGTTTTTAAACTGTTTTTTGGTTTGTTATGATAAGAATAGTTGTTTGGATTTT
CTTAAATTTTATTTCCATGATGACTAAATATACGATTCTATCATCTTAATTTTCGGTTTT
CTCATTTTACCTTTGCCATGGGTTAAACTAATTAGTCGGCTTTTAAATTAATTTAGTTAT
GTGAAATATACATTTTTGTGTTAATAAATACTGTTTTTTATCCCAATAAATTTCAAATAT
TTAAGTTTTTCATTACGAAGTTCTAGATTGAATGTTTGTTGCAAAAATAAACATTTTCAA
AAAAGAAAAAAATTAGTGACTATGACTAATAGCAATGTGACCATATCAGTTTTCGCTCTA
TTATTCGTTTAGATTCATTTGTTTTTTTTTTCAAATCGAACCGTAAAATTTAATTACAAA
ATTAGTTCGTTTTTCAAAAAAAAATATTGTTATTGTGGCTTGTGGGGAATA

Last Updated on 06.12.2018 16:11