Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 134C07 and hit At2g38530 are shown.
Line ID 134C07
Locus At2g38530 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr2:16128736
Primers used for PCR 71za - 8474, show primer details
   
Sequence Name 19-K123937-0022-134-C07C-71za
GenBank Accession queueing for submission to ENA/GenBank
Sequencing primer gene specific primer, 71za: 5'-TTGTAGTGTGACAGTGCCTACGTC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>19-K123937-0022-134-C07C-71za
TTTGTATTGTTTCAAATTATAGGTGTGTAGATAGGAACATAGTTAGTTTACTTCTTTTAA
AAAAAATTAAAATCTCGTTTATCTAACATGAAAACTGCTTTACAAAAAGACCTGATGAAA
AGTGATTATTTTACCAAAAAAATACATTTTACTAACGTACTCTCATGTTTTTTTCTGAAT
TTTTATAGTTTTGTTTATTTATGTATTTCGAAGACTTAAGTCTAGTTGAGAAATAGTTAT
TTTACAAACTATAGATGTGCTATATATTCTAATCGTCTAGTTTATCTTAACAACATATTA
TTCATATATATATTTGCATGTGTTTATCTTTTACATGACTCTAATAAGAATCATGCTATC
CATTGTCAATAATATTTTCGACACGTGTACGTGTATAAGTTAACTTTGTTTTTTTTACAA
AAGTCATTTAAATAAAACTGTTGTTAAGAGTTAGTACTAAGAAATCATTCTATCTTTATT
TCGGTTATCTATTTTATTTCCTGTTATAAAATTATTTGAACGAATTCGTTTCTCTTCGGT
ATCATGCAAAGGGTAATTAATTTATTTTAAAAACTGTGTGTTGATGAGAGATTAACAATA
AGATTATGATTGTTTGGATATAATGATAAAGATTTAAAACTTAGACATTTTTATTGATCT
TAATTATAATAGCAAAAAAAAAGTAAATAACTTACATTTGGAAAGTCATGTTTTCGAATA
TACTGATCAACTAGTATTAGTAGATATCTGACTTTTATCATTATATAGTCCAAAAACTAG
TGTGGACTTTGGTTTTGAGATTCCCGATATCAAACAAAAACAAAATGTTGTTTACTTGAT
ACTTCCCAACTGTAATGCAAGTTAATCATTTTGGTCATATCGATTAAACTAAAGTAAGTG
TTAG
   
Sequence Name 03-K123936-0022-134-C07C-8409
GenBank Accession queueing for submission to ENA/GenBank
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>03-K123936-0022-134-C07C-8409
TCGGACTGAGCATTTACAATCTTCTTTCATTTACCCGGTCTCAACACTGCCCGTGCAGCT
GGACTTCCTAGCGCATGCAAAGTCAATATTCCTTACAAAATCAGCGCCAGCACCAACTGC
AACACGTATGTGATCTTTTCACTCTTATAAGTATATGTTATAAATTTTTTAGTTTATTTT
GTTAAATATTGGAAACTTATATTAACGTTGTTATGTTAATTTGTATGTGAATGCAGCGTG
AGGTGATGAGCGACGGTCAAATGAAGCTACTAGCGGATGTTTCGAATATTATATAATCGA
TGAGATAATATTAAATAAAGATGTTCGAATGGCTGTACTCTTTTCAATTTCCTGTCTTTT
TTTATCGTGGCGTTTCTATTATGTGATCGTCTGTACTATGTTCGCAAACAACGTTCTTTG
AATTTCAGACTTGAAGTTTAAGTTATTCTATACTCTATATCTATACTAACACTTACTTTA
GTTTAATCGATATGACCAAAATGATTAACTTGCATTACAGTTGGGAAGTATCAAGTAAAC
AACATTTTGTTTTTGTTTGATATCGGGAATCTCAAAACCAAAGTCCACACTAGTTTTTGG
ACTATATAATGATAAAAGTCAGATATCTACTAATACTAGTTGATCAGTATATTCGAAAAC
ATGACTTTCCAAATGTAAGTTATTTACTTTTTTTTTGCTATTATAATTAAGATCAATAAA
AATGTCTAAGTTTTAAATCTTTATCATTATATCCAAACAATCATAATCTTATTGTTAATC
TCTCATCAACACACAGTTTTTAAAATAAATTAATTACCCTTTGCATGATACCGAAGAGAA
ACGAATTCGTTCAAATAATTTTATAACAGGAAATAAAATAG

Last Updated on 06.12.2018 16:11