Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 176A08 and hit At1g29050 are shown.
Line ID 176A08
Locus At1g29050 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr1:10138994
Primers used for PCR CS31 - 8474, show primer details
   
Sequence Name 60-K031320-022-176-A08C-8409
GenBank Accession LN510161 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>60-K031320-022-176-A08C-8409
TTACAATTGAATTTGAAGCAAGGCCTGCTCGACTCCCGACAAGATTGTGACTGTTAGAAG
TGGAAGAAAAAGAAGGAGGAGAGAGATGAGTTTGAAACCCATCTTTGTAAAATTAGACAA
ATATCAAAGGTTTTGGGTTTTTGTGATGAAGCTTGTTCGATGGGTTCAAGCTTTTATACA
CTCATTTGTGTATGTATATATGCACTAATGCATGTACATACATATAATTATGATAAAAAG
TTTCTGTGCATATTTCTTAATGTGATTAAATAATACTTATATTTTAATGTACACAATTAT
GTCAATTATGAAACCCAAGCTAGTGGCACGGTTAGGTGATCTCAACTCTAATGCCACGGA
CGTACAATAGTATTTTGTTGTAGTTTTGGGTCCGATTTTACCGTGTACATTAAAAACTTG
ATGTTCCAGTAAAATCAAAATTTGTTTAAATATATCTATTTCTAACTAATCAATTTTGAG
TTTTGAATCAAAAATGGAAAATTATACCTCTTAAAGTCTTAATACATGTCTATTACAAGA
TTATTTTGACGACGAATATAACACATGATAATAAGAATTATTAAGAAAATAACTGCTTAA
TTAGCTTTTTTTGTTCGTTTTTTAGGTGTGAAAGTATGTTCCTAGAAAGCTTCACAAACT
TGCATTATGTCGCTGGTCTTGTTACGCAACAAAATCTAATCTTTTTCCTTGTAGAGAATG
ACATTAAATTGACATCCGAAAGATGTTAGNTTCCATC
   
Sequence Name 61-K031320-022-176-A08C-CS31
GenBank Accession LN510429 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, CS31: 5'-GAGATGGACTTAACATCTTTCGGA-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>61-K031320-022-176-A08C-CS31
AAAAGATAGATTTTGTTGCGTAACAAGACCAGCGACATAATGCAAGTTTGTGAAGCTTTC
TAGGAACATACTTTCACACCTAAAAAACGAACAAAAAAAGCTAATTAAGCAGTTATTTTC
TTAATAATTCTTATTATCATGTGTTATATTCGTCGTCAAAATAATCTTGTAATAGACATG
TATTAAGACTTTAAGAGGTATAATTTTCCATTTTTGATTCAAAACTCAAAATTGATTAGT
TAGAAATAGATATATTTAAACAAATTTTGATTTTACTGGAACATCAAGTTTTTAATGTAC
ACGGTAAAATCGGACCCAAAACTACAACAAAATACTATTGTACGTCCGTGGCATTAGAGT
TGAGATCACCTAACCGTGCCACTAGCTTGGGTTTCATAATTGACATAATTGTGTACATTA
AAATATAAGTATTATTTAATCACATTAAGAAATATGCACAGAAACTTTTTATCATAATTA
TATGTATGTACATGCATTAGTGCATATATACATACACAAATGAGTGTATAAAAGCTTGAA
CCCATCGAACAAGCTTCATCACAAAAACCCAAAACCTTTGATATTTGTCTAATTTTACAA
AGATGGGTTTCAAACTCATCTCTCTCCTCCTTCTTTTTCTTCCACTTCTAACAGTCACAA
TCTTGTCGGGAGTCGAGCAGGCCTTTGCTTCAAATTCAATTGTAAATGGCTTCATGTCCG
GGAAATCTACATGGATCAGCAATGAGTATGATGGTCAATATGGAGAAAAAGAAAGAGTAA
TTACCAATTTTTTTTCAATTCAAAAATGTAGATGTCCGCAGCGTTATTATAAAATGAAAG
TACATTTTGATAAAACGACAAATTACGATCCGTCGTATTTATAGGCGAAAGCAATAAACA
AATTATTCTAATTCGGAAATCTTTATTTCGACGTGTCTAC

Last Updated on 06.12.2018 16:11