Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 182G08 and hit At3g54940 are shown.
Line ID 182G08
Locus At3g54940 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr3:20355362
Primers used for PCR 15nb - 8474, show primer details
   
Sequence Name 21-K114626-0022-182-G08C-15nb
GenBank Accession LN495768 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 15nb: 5'-GAATATTTGCCAAAAACGTCCTTA-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>21-K114626-0022-182-G08C-15nb
CCGTCCACGGAGTCCACAGTTCTCTGACCTCACGGAAGAGGAGTTCAAGCGGATGTACAC
TGGAGTAGCCGATGTTGGCGGCAGCCGTGGCGGTACGGTTGGAGCGGAGGCACCTATGGT
TGAGGTTGATGGATTGCCTGAAGATTTTGACTGGAGGGAGAAGGGTGGAGTTACTGAGGT
TAAGAATCAAGTATGTTCTTATATATATCCATATGATTTGCCTTAGGCTTGGCTTACATA
TTTTATTGCAACTTAGAAAGAATGTGAACTATTAATTTTGATGCAGCCAAAAACATAAGG
AGAAGTAGTTCTCTAGGTGGTACCATTTGTTTTATTTTGTAATTAGGCACGTAATTATAC
TAATTAGGTAAGAGTATTATCTAAGTAATTGATATTAGTTGGCTCAGGAATGACTCTTTT
GAGCTCTAATTAATTTTGGATGACAAAAAAAAAAAATTTTATTTGGATATATAATTCACT
TGGTAGTAATTTAATACTTTTACCCAAAATTGTCTAATTTGTGAAACAAATGTTTTTTGG
GGTTAATTTGGGGAACATTTACTTCATACAAACTTCAAGGCCTGTCATTTTACCCATATT
TCAGGCAGGTAATTATTTAAAGGGTGCATGTGAATCGTGCTGGGCTTTTACCACACCGGG
ACCACCTAAAGGACCCCTTTTCTTCTTACCATTGATTATATTCAATTGTAATTGGCTTCT
TGTCCGGAAATTCTCCTTGGATCACCATTGATTATGATGGTCATTATGGAGAAAAAAAAA
AATTATTTCCCATTTTTTTTTCATTTCAAA
   
Sequence Name 21-K114625-0022-182-G08C-8409
GenBank Accession LN495767 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>21-K114625-0022-182-G08C-8409
TTGAATATACTCATTGCTAAGACGAAATGGGCTCCTTCAGCTGCTCCCGTTGTGCTAAAA
GCCCAGCACGATCCACATGCACCCTTCACATAATCACATGCATGATATATGGTTAAACTG
ACAGGCATTGAAGTTTGTATGATGTAATTGTCCCACAAATTAACCCCAAAAAACATTTGT
CTCACAAATTAGACACTTCTGCGTAAAAGTATCAACTTACTACCAAGTGATTTATATATC
CAACTAATATCTTTTTTTTTTGCCACCCAAAATTAATTAAACCTCAAAAAATTCATTCCG
AACCCAACTAAAATCAATTACTTAAATAAAACTCTAACCAAATTATTAAAATTACTTGCC
TAATTACAAAATAAAACAAAGGGTACCCCCTAAAAAACTACTTCCCCTTATGTTTTTGGC
TGCATCAAAATAAAAATTTCACATTCTTTCTAATTTGCAAAAAAATATGTAACCCAACCC
TAAGGCAATTCAAATGGATTTTTATAAAAACATACTTAATTCTAAACCTCATTAACTCCA
CCCTTCTCCCTCCATTCAAAATCTTCAGGCAATCCATCACCCTCAACCATAGGTGCCTCC
CCTCCAACCGAACCGCCACGGCGGCCGCCAACATCGGCAACCCCGTTGAACATCCCCTGA
AATTCCTCTCCCTTGAGGTCAAAAAATTGTGTAACTCCTTGAACGGCGAAGGGTTCCATC
ACCTGGTGCTCTCCGCCCTTAAGGACTTTT

Last Updated on 06.12.2018 16:11