Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 303F06 and hit At4g37260 are shown.
Line ID 303F06
Locus At4g37260 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr4:17540503
Primers used for PCR CM50 - 8474, show primer details
   
Sequence Name 14-K104151-0022-303-F06C-CM50
GenBank Accession LN492486 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, CM50: 5'-TTTTATACCCAAACGTTAACGAGG-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>14-K104151-0022-303-F06C-CM50
AATTTGAACTATAACAATGGTTAATCATACGTTTAAATTAATTAAATTCACCAATATTTT
TTTGACTGAATGAGTCAAAATTGTTTAACGAGTAACGACCATAATTATCAGTTTTTATTT
TTTATTGTTTGAACTACCATAGTTATCCGTTTAACACTGAGCAAATCTCTTTATTAATAG
AGAAAACGGTTTTATTTGTTTCCTTCTATAAAATTTGTTTTTAATAATACGTTAGATATT
TTTATGCAGTTAAGGATAATATTACACTGTAAAGTTTAACTAGTTTAATATCGTTTCTGT
TAAATCGATAAGAAAAAATTACCGGTTGAACCGGTGACCCTTTTGCCCACTCCTTTCTCG
TATAAATACTCTCTCTTCTTGCTCTTATCCTCTTCAACCAAAAAGCTTTTCAATTGTAAA
TGGCTTCATGTCCGGGAAATCTACATGGATCAGCAATGAGTATGATGGTCAATATGGAGA
AAAAGAAAGAGTAATTACCAATTTTTTTTCAATTCAAAAATGTAGATGTCCGC
   
Sequence Name 14-K104152-0022-303-F06C-8409
GenBank Accession LN492487 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>14-K104152-0022-303-F06C-8409
AGCCATTTACATTGAAAGCTTTTTGGTTGAAGAGGATAAGAGCAAGAAGAGAGAGTATTT
ATACGAGAAAGGAGTGGGCAAAAGGGTCACCGGTTCAACCGGTAATTTTTTCTTATCGAT
TTAACAGAAACGATATTAAACTAGTTAAACTTTACAGTGTAATATTATCCTTAACTGCAT
AAAAATATCTAACGTATTATTAAAAACAAATTTTATAGAAGGAAACAAATAAAACCGTTT
TCTCTATTAATAAAGAGATTTGCTCAGTGTTAAACGGATAACTATGGTAGTTCAAACAAT
AAAAAATAAAAACTGATAATTATGGTCGTTACTCGTTAAACAATTTTGACTCATTCAGTC
AAAAAAATATTGGTGAATTTAATTAATTTAAACGTATGATTAACCATTGTTTATATGTTC
ATAATTATGTGTCCATAAATGGGCTACGTACAAACCTCGTTAACGTTGGGNTTATAAA

Last Updated on 06.12.2018 16:11