Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 330C06 and hit At4g35670 are shown.
Line ID 330C06
Locus At4g35670 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr4:16916775
Primers used for PCR SD24 - 8474, show primer details
   
Sequence Name 03-K103500-0022-330-C06C-SD24
GenBank Accession LN487453 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, SD24: 5'-ATTGAAAACGTGGGTAAACTTTTG-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>03-K103500-0022-330-C06C-SD24
TCATCAGAACTAGTGTTATTTTTAAAGCAGTCTCGCATCAAATCAGTGTCACTGGACTCT
CCATCAACATATTGACAATTAACTTTAGGCTTTCCTCCATTTGCCATGGTAATATCAATT
CCATCCATAACGACGTCTACACAATGTGTAGTTTCGCTACATTTAAGCGTTATAGCATTT
TTATTTGACGATGTTCCGCGAAAATCGACAAATTTTACATTACTAATAGCTACTGCTGAT
TCCTGTTGAACATAAACACATGCAATCATATATTTTCACAATTTAATGATACTTTCAAAA
TTAGTATTAATATAAATATATTTGTATTTATAAATTATTAAAAAAGTATTTACCTCTGTA
AGACGTCCTTTATCTATATAATGTTGGTCGATTATAATTGGATTTTTTGTGTTAACGAGT
GTGATGTCCAGCCATGTAAATACATTTTTCAATTGACCTCTTCAATTTACAATTGAATAT
ATCCGCTAACCGTTGTCGGCATCGATTAAATTGTTCATTGTTGGTTTTTTCCACATGTTT
ACAACTAAACAGGATATATTCAATTGTAAATGGCTTCATGTCCGGGAAATCTACATGGAT
CAGCAATGAGTATGATGGTCAATATGGAGAAAAAGAAAGAGTAATTACCAATTTTTTTTC
AAATCAAAAATGTAGATGTCCGCA
   
Sequence Name 19-K103501-0022-330-C06C-8409
GenBank Accession LN494726 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>19-K103501-0022-330-C06C-8409
GCCATTTACAATTGAATATATCCTGGTTTAGTTGTAAACATGTGGAAAAAACCAACAATG
AACAATTTAATCGATGCCGACAACGGTTAGCGGATATATTCAATTGTAAATTGAAGAGGT
CAATTGAAAAATGTATTTACATGGCTGGACATCACACTCGTTAACACAAAAAATCCAATT
ATAATCGACCAACATTATATAGATAAAGGACGTCTTACAGAGGTAAATACTTTTTTAATA
ATTTATAAATACAAATATATTTATATTAATACTAATTTTGAAAGTATCATTAAATTGTGA
AAATATATGATTGCATGTGTTTATGTTCAACAGGAATCAGCAGTAGCTATTAGTAATGTA
AAATTTGTCGATTTTCGCGGAACATCGTCAAATAAAAATGCTATAACGCTTAAATGTAGC
GAAACTACACATTGTGTAGACGTCGTTATGGATGGAATTGATATTACCATGGCAAATGGA
GGAAAGCCTAAAGTTAATTGTCAATATGTTGATGGAGAGTCCAGTGACACTGATTTGATG
CGAGACTGCTTTAAAAATAACACTAGTTCTTGATTGAGAATGTACATCAATAGTCAAAAG
TTTACCCCNTTTTTCA

Last Updated on 06.12.2018 16:11