Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 429B07 and hit At3g16260 are shown.
Line ID 429B07
Locus At3g16260 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr3:5509462
Primers used for PCR 16xu - 8474, show primer details
   
Sequence Name 46-K119622-0022-429-B07C-16xu
GenBank Accession queueing for submission to ENA/GenBank
Sequencing primer gene specific primer, 16xu: 5'-GTAGAGAAGCTACTAGGCCGGAAC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>46-K119622-0022-429-B07C-16xu
TTTTTGAAAATAAGATATTAAACAGAACCAAAGAAAAAGGTTGGGTCCTTAATTGGGATA
ATGTTTTATATGCCATGAGGTTACTGTGGAGGCAAGTGGTGCATCTTTTTATCTCTAATC
CAAAGTGTGTATGCGCCGGTTTAGTCTATTGACTAACCAAATTAAATTAGTTAATAGAAA
CGTTGAAACGTTTTCCCCCGTATATAGGAAAAATATTGGGGTTGAACCTTCGTATTCACT
CCTTTAATTTAAATCAATAATTTTGAGAAAACAAAATTTGTAGATTTTTAATTAAATAAA
GTTAATTATCTGTAGAATTTGAACTTTATAATCAAACGAAATTATATATCGGTTTTGAGT
TTATATATATGAATTAGGTTTTAGATTTTACAATTAAATAAAATTTTATATTGGTTTGGG
ATTACAAATGTGGATTAGGGTTTTGATTTTACAATTAAATAAAACTTATGTCGGTTTAAT
AAGTGTTATGGCATTAGTTACTTGGTCTATGACCAGACCACCCTAATGTTGTGTCCTGGC
GACGATGAAACTGGACCGGCTTGCATCTATATTGTCACGGGAGATTTTTTCAAGAAGATT
CAAATTGGTTTTGGTTTCTGGTGTTTTCATTGTGTTTATTCTCCCAGTTTTGTCCTAGTT
CCTTTAGGTTAAGATTGCAAGTCTAATAATTTTATCACATTTTCTTGAACTTTGTTCATG
TCTCTGTTTTCTTAGTCTTAAGTCAGTTTGTCTAAAATTTTCTTGATGATAAAAATATAG
ACTTACGATCTCCAACATTGTTGATCAACACACTTTCACTTTGAACTTAACCAAAAAGGT
TTGTCACCATTGAGTAAAAATGTTACAAAATATATACGTAAGTAATGTA
   
Sequence Name 22-K119620-0022-429-B07C-8409
GenBank Accession queueing for submission to ENA/GenBank
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>22-K119620-0022-429-B07C-8409
CATTTACAATTGAATATCCGAAGAAGACTTGAGAGGAGAAAATCCGAAAAGGCTTAGGTT
TTGAGGCATTGATGAAGTTAACATTTTTCCTCAAGCTAGTGAGTGACAAGCTCAAGCTTC
TTCCCGTTTTTTTTTTCTCAAAGTCTTCTCCTTCGAGGATCGATTTTTTTAATGAAATTG
TCAATTTAGCCCAGGGGCCTTTGTATTACATTTCCGGCCCATCAAAGGTCAACTACACCT
TATTATTCACAACTCTAACATTACTTACGTATATATTTGGTAACATTTTTACTCAAGGGG
GACAAACCTTTTTGGTTAAGTTCAAAGTGAAAGTGTGTTGATCAACAATGTTGGAAATCG
TAAGTCTATATTTTTATCATCAAAAAAATTTTAAACAAACTGACTTAAGACTAAAAAAAC
AGAGACTTGAACAAAGTTCAAGAAAATGTGATAAAATTATTAAACTTGCAATCTTAACCT
AAAGGAACTAGGACAAAACTGGGAGAATAAACCCAATGAAAACCCCAAAAACCAAAACCA
ATTTGAATCTTCTTGAAAAAATCTCCCGTGACAATATAAATGCAAGCCGGTCCAGTTTCA
TCGTCGCCAGGACACAACATTAGGGTGGTCTGGTCATAAACCAAGTAACTAAGGCCATAA
CACTTATAAAACCGACATAAGTTTTATTTAATTGTAAAATCAAAACCCTAATCCACATTT
GTAATCCCAAACCAATATAAAATTTTATTTAATTGTAAAATCTAAAACCTAATTCATATA
TNTAAACTCAAAACCGATATATAATTTCGTTTGATTATAAAGTTCAAATTCTACAGATAA
TTAACTTTATTTAATTAAAAATCTACAAATTTTGTTTTCTCAAATTATTGATTTAAATTA
AAGGAGTGAATACGAAGGGTCAACCCCAATATTT

Last Updated on 06.12.2018 16:11