Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 539F12 and hit At3g32980 are shown.
Line ID 539F12
Locus At3g32980 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr3:13527822
Primers used for PCR 12ak - 8474, show primer details
   
Sequence Name 30-K106739-0022-539-F12C-12ak
GenBank Accession LN499736 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 12ak: 5'-CTGGGCTAATTAACCACTCTGGTA-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>30-K106739-0022-539-F12C-12ak
ACGTGATATTTTTGTTTTTACTATCGAGTATCTTAGCTCTTGCCGTCAAATATGACTCAT
GCCTTTTAAAAAAATGATTTCACAACATTTAGTATAATTTGATCTCCCATTCAACGAACG
TAAATTATCCGTATAATAATTTAAGAAAAGCATGGACCCGTACTGTACCAAACACGTTAG
GAGTTTATATCAATCATTTATTGAATGTTACAAAATAACATATTAACATATTATATAAAT
CGTGTATTATTTATGGGAAGTTGATCAGATCGATGTAGTTGTTAACCTAAAACATAATGT
TGAATTTATGCGTTAGAAGATTAATATAATGTAAACTAAAATGTATACTAACTTGTTTAC
ACTATATCACCACGCGTTGCTTAAAAAGAACAAACCTTTTTATTGAATGAAAATGCAATC
TAACACTTTTTGTAGGTATACTAAATATGTCATCATGAAAAGAAAAAACTATATATCATT
ATGATTTCAATATATGTTGACTAATTAATTAGTGAACACATAATCTAACAGGATATATTC
AATTGTAAATGGCTTCATGTCCGGGAAATCTACATGGATCAGCAATGAGTATGATGGTCA
ATATGGAGAAAAAGAAAGAGTAATTACCAATTTTTTTT
   
Sequence Name 14-K106738-0022-539-F12C-8409
GenBank Accession LN492524 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>14-K106738-0022-539-F12C-8409
GCCATTTACATTGAATAATCCTGTTAGATTATGTGTTCACTAATTAACTATTCAACATAT
ATTGAAATCATAATGATATATANGTTTTTTCTTTTCATGATGACATATTTAGTATACCTA
CAAAAAGTGTTAGATTGCATTTTCATTCAATAAAAAGGTTTGTTCTTTTTAAGCAACGCG
TGGTGATATAGTGTAAACAAGTTAGTATACATTTTAGTTTACATTATATTAATCTTCTAA
CGCATAAATTCAACATTATGTTTTAGGTTAACAACTACATCGATCTGATCAACTTCCCAT
AAATAATACACGATTTATATAATATGTTAATATGTTATTTTGTAACATTCAATAAATGAT
TGATATAAACTCCTAACGTGTTTGGTACAGTACGGGTCCATGCTTTTCTTAAATTATTAT
ACGGATAATTTACGTTCGTTGAATGGGAGATCAAATTATACTAAATGTTGTGAAATCATT
TTTTTAAAAGGCATGAGTCATATTTGACGACAAGAGCTAAGATACTCGATAGTAAAAAAC
AAAAATATCACGTCTAACTACCGTAAATTTTATATTGATATATATATACCAGAGTGGTTA
ATTAGCCCAGAAAAAAAA

Last Updated on 06.12.2018 16:11