Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 752B08 and hit At1g45201 are shown.
Line ID 752B08
Locus At1g45201 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr1:17127821
Primers used for PCR 33oc - 8474, show primer details
   
Sequence Name 40-K114782-0022-752-B08C-33oc
GenBank Accession LN503804 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 33oc: 5'-TAGGAGATGAGGACTTTGGTGAGT-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>40-K114782-0022-752-B08C-33oc
TTCGTCTATACAATGATGTTGTGCCTAGAGTGCCCTTTGATGACAAGTACTTATTCTCAT
ACAAGCACTATGGACCTTGCAATTCCTTCAACAGTCTCTACAAAGGAAAGGTACATTAAA
TCAGCCTCTATCTAATTATTGGGGTTTTGTCTTGCTATATTATTTTAAAAAGACAAAGAA
TAAAGAGATTCATCANAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAGGGGGGTAAATTTTTAAGTTGA
ACTTAAAAAACCTTCCATTTTTCCCTTTTTTTTTAAAAAAATTGTCATTAATTTAAAAAA
TAAAAATTACCCTTTTTTTTTGAATTTTAAATTGAACTTTTTTTAAAACCCTCAAAAAAA
CGGGCAATTTTTTCTAAAAAACAAAAAAAAGGTCCCAATTTTTTAAAACCCAACAAATTA
ATTAACTTTTAAACCCCAAACCCTAAAAAAAAAAATTTAAACCCCCCCCCATTAATTTTT
CCATTTGAAATGGGTTCCTTTTCCGGAAATTCTCCTGGAATAACCATTAATTATAAGGTT
AATTTTGAAAAAAAAAAAAAATTATTTCCCATTTTTTTTCAATTTCAAAATTGTAATTTT
CCCAAA
   
Sequence Name 40-K114769-0022-752-B08C-8409
GenBank Accession LN503803 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>40-K114769-0022-752-B08C-8409
ATCCTTCTTTCTTCGCGTTCGGGTTTCAGAGTTAATTTACTTTCGTTGGCTTTTAAAAAT
ATGGACCATGTTATTAGTTTTATAGAAAATATTGCCTTGTTTTTTGAAGAGTCTAAAACA
AAGTACAATTAAAACTCAAAATAAATAGGTTATTTATTATCTTTTATATCATCGACATTT
CTCTAAAAAACAAAGGAAAAATTGAAAGTTTCTTCATGTCCACTTTAAATATTCACCCTC
TTTATTCTTTGTCTTTTTTTTTTTGAAGAAACCCCTTTATCCTTTGCCTTTTAAAAAAAA
TATGCCAGAACAAACCCCCATTATTTAAATGGGGCCGAATTTAAGGTCCCTTCCCTTTGA
AAAACCTTTTAAAGAATTTCCAGGGCCCATATTCTTTGTTTAAAAAAAATTCTTTTTCTT
CAAGGGGCCCTCTGGGCCCACCTCCTTTTTTTTAAACAATTCTTTAAACCTCTTTCCCAG
GTTTTTTCCCCCCCCCTTTCAAAACCCCCCCA

Last Updated on 06.12.2018 16:11