Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 945E06 and hit At1g62580 are shown.
Line ID 945E06
Locus At1g62580 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr1:23174973
Primers used for PCR 12pb - 8474, show primer details
   
Sequence Name 47-K114954-0022-945-E06C-12pb
GenBank Accession LN506284 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 12pb: 5'-AAAAAGTGGAGAGTCAAGTCT-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>47-K114954-0022-945-E06C-12pb
GGTCACTATACAGAGCCTCGTCATGCTCTAATACCTGGTAATAAAATTAACCACTCATTT
TCCATCGGTCTTGGTTTTTTTTTTTTCCAAATTTTTTCCATAAAACCCCACCAATTTATT
TGAAAAATTATTTTTAAAAAAAACCCTATTTTTTGGAAAAAAATAACAAACTTTGCCCTT
AAAAAAAAAATTTTAAAAAATAAATTAATTCCTTTTTTTAAAAATTAAAAAGTCAAAAAC
CAATTTAATTAATTAAATTTAACCCAAAAACAAAAAACCTTTTTAAATTTTTTTTACCGA
ATTTTGGGCCAAAATTTAAAAATTTAATTTCAATTTCCAACCAATTATTTTAAAATTTTA
AACCTTAATACCCACAAAAATTAAAAACCTTTTAAATTTTTTAAGGGGGAAAAAGGGATT
CAATTTTTAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAAAATTTACGGGTTTAAATCCATTTTAAAACC
AAATGGTTTTCCACCGGGAAAACCTTTAAATTAACCATCCAAAACCCATTTTTTTTTTTT
AAACCCTAAACCATTTAAATTATTTCCACCAAACCTTTCCCCCCCCCAATTTACTTATCT
TTTAAAATCAAAAAAAATTTTTTCAAAATTTTTTAACCCACTTTACAAAAAAATTTTTTA
TTTTAACTAAAAAAAAACCCCCCCCGCTTTAAAAGGCCAGTTAAAATTTTAAAAAACCCA
ATTCCCCTCCCCATGGAGTTTCCTTTCTCCATACCCCCCTTTTAAAAACTTAAAACTTTT
CAAAACCCTCTGGTATATTCAAAT
   
Sequence Name 13-K114953-0022-945-E06C-8409
GenBank Accession LN492157 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>13-K114953-0022-945-E06C-8409
ATTGATATTTTTTTAGGGCCTAAAATTTTTTATCCAAACTGACCCAAACCCAACTGGACC
CGACCCGAACCGAATATTTAGAATTATTCTATTAGGTAGTAAATCATATACCCATTAATC
CCAAACCCGAACGGGTTCTACCCGAACTCCAATGGGTTACTCATATGCCCAGCCCTATTC
TCTGATTTAATTATCTAAAAAATCCCAATAAAACATATGTTTTGCTGACTACTTTTTATT
CAAAAAAATTTACATCTTCTTCTGCCAAAATCATTTCATAAGACATCCCAAAACCCTTGG
AATAATGATTCCATGAATGAAGAATCCTAATTTGAATATACCAAGAGGTTTTGAAAAGTT
TTAAGTTTTTGATAGGTGTGTATGTGAGAAGGTACATCCATCGTGATGGTAATCTGCTTA
TTTATAATTTTAACTTGCATTATACAGCAGGTAGGCTTATATTTTAGTTAAACTAAAAAC
TTTTATTGTAAAGTTGATTATAAATATATGATATAATTTTATTTGATTTTAAATGTATAG
TAAACTGCGAGTTGTATATGTTTTGTTGATATTATTTATATTGTTTAGTGTTTAAAATTA
TATACTTGTATTTTGATTGTTAATTTTAGAGTTTCACCTGTAGTATACCATCTTGTATTA
ATATTGATTTAAACCCGTCAATTCTAGGATTTTCTATCTTGTATTAAAAATTGAATCACA
TCATACACATTAAAAAATCTAATATGTTATTAATTATTGTAGTATATAAGATTATAAATT
TTAAAATAATATGTATGAAATTGAATATAAATATTCAAATTATGACACAATACTCAGTAA
AAAAAATTTAATAATGTATTTCGTTTTTGAGTTAAATTTAATTAATTAAATTAGTATTTG
ACTTTTTAATTTTTAAAGAAATGAATTAATTTACTTTTTAAAATTTTATTTCTAATGGCA
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Last Updated on 06.12.2018 16:11