Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line SALK_064292 and hit At5g43380 are shown.
Line ID SALK_064292
Locus At5g43380 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr5:17419862
Primers used for PCR 36uv - LBb3, show primer details
   
Sequence Name 01-K117319-SALK_064292C-36uv
GenBank Accession LN484291 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 36uv: 5'-CATCAGCTAAAACTTTGTGTCCAA-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>01-K117319-SALK_064292C-36uv
CAAGAATATGAGTGAGTAGGAATCCTAACTTAACAAACATCCAAATTTAAATATTTGTTC
AGTTTAATTCGGTTCTTTAGTCAAACCGTTTAATTATACCAGATATCATAAATTCTAAAC
TTTTTAAAAAATTAAAATATTATAATTGATCTATTTAAAGTGTATAAAAACTTCAAAATA
TTATCAACGTTTAACTTATAAAAAGTTTAAAATATCACGGTATGGGTTATATGGTTTGAC
GAGTTTGAATCTTCATTAATATAAATTTAAATATCATTAACTCGGTGGTACAACATGGGT
AAGTCATCATTTTAATATTTTGTTAACACTAGCAATATTATAATGATATGTCAAGTTAAA
TTGATTCAATTATGATTATGTATTAAAACAAGATATATAAGTATTAGTTTTCTAGGTATC
TGCAATATTAGAAACCAGATATCCAAAAGTCACGGATCTGGATTGTTAAAGCACAGTAAC
ATTGCGGACGTTTTTAATGTACTGGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACA
GCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTT
GCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTCCGAATCCGGCCAAAA
   
Sequence Name 17-K117318-SALK_064292C-R210
GenBank Accession LN484759 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, R210: 5'-CCCAGTACATTAAAAACGTCCGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>17-K117318-SALK_064292C-R210
CTTTTGGATTCTGGTTTCTATATTGCAGATACCTAGAAAACTAATACTTATATATCTTGT
TTTAATACATAATCATAATTGAATCAATTTAACTTGACATATCATTATAATATTGCTAGT
GTTAACAAAATATTAAAATGATGACTTACCCATGTTGTACCACCGAGTTAATGATATTTA
AATTTATATTAATGAAGATTCAAACTCGTCAAACCATATAACCCATACCGTGATATTTTA
AACTTTTTATAAGTTAAACGTTGATAATATTTTGAAGTTTTTATACACTTTAAATAGATC
AATTATAATATTTTAATTTTTTAAAAAGTTTAGAATTTATGATATCTGGTATAATTAAAC
GGTTTGACTAAAGAACCGAATTAAACTGAACAAATATTTAAATTTGGATGTTTGTTAAGT
TAGGATTCCTACTCACTCATATTTCTTTGGGTTCAATTTGGTCTTATTTATGAGATTTTG
GACACAAAGTTTAAGCTGATG

Last Updated on 06.12.2018 16:11