Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line SALK_075679c and hit At2g20850 are shown.
Line ID SALK_075679c
Locus At2g20850 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr2:8975701
Primers used for PCR 05as - R204, show primer details
   
Sequence Name 52-K107035-SALK_075679C-R210
GenBank Accession LN485548 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, R210: 5'-CCCAGTACATTAAAAACGTCCGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>52-K107035-SALK_075679C-R210
CGTCATTTGTTTACCCACAATATATCATGGGGATAATCAGTATACGGGAAGAAGATAGTT
TAAGGAGATTGTCTCTTATACAAAACAAGTGGTATTATTAGTATTCTTTAGAAAGTCGAA
ACCATTGTTCTTTAACGAGCCTTGCTTGTATTATTATATATGTAGAGTGTGTGAGTGTGA
CACAGGCACACAGCTTACTCTGCTTTGGCCTTTTAGTCTATCCACAACACCCCCAATGTA
TTTCCACCGGATTAGGATTAGCAATCTCTGAGTTTTTCCAAAAATCCATAGTACTGCTAC
TTCAAATTTTGAATCTTTTTTCTTTCTAAATAGTATTTTATCATATTCTTCATAATATGA
TTCATCTCTTTAGTTTTGTCAACCAATAATGTTTTGTTTCTCGTTTCAGTGTGATGATGA
TTGTGAATTAGATAAAGCAACTACGGTAAAACCACTATAAATTAAAACTATGCAGAAAAT
AATAAATTATACCGGTCTCGAGTCGGATTAGTGTAAAATTAACAAAATTCTAGATAAAAG
TATGGTATCAATAACATCATAAATTAATAATCACATAATTAGATCTATATTTAAGTTAAT
ATATAATCTATGGTTTTAATTTTTTTTAAGTATTGAATTTTCGTTAGAGTATTTCTCAAA
CTTTTATTGAATCAACCAATTGTTTTGTCTCTAAATTTAATTGAATTATGTTGTGTTTTT
AAACTATCCTATGATAGTATATCGTTTATAACTTCGTAATACAATTAGCCATTATTTTTT
TGCAAATTTTCAACTTTTTGGTATGCTCAATTGTTCA
   
Sequence Name 60-K107036-SALK_075679C-05as
GenBank Accession LN485732 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, 05as: 5'-AATGAACATGATGCATACCAAAAA-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>60-K107036-SALK_075679C-05as
AATATGGCTATTGTATTACGAAGTTTAAACGATATACTATCATAGGATAGTTTAAAAACA
CAACATAATTCAATTAAATTTAGAGACAAAACAATTGGTTGATTCAATAAAAGTTTGAGA
AATACTCTAACGAAAATTCAATACTTAAAAAAAATTAAAACCATAGATTATATATTAACT
TAAATATAGATCTAATTATGTGATTATTAATTTATGATGTTATTGATACCATACTTTTAT
CTAGAATTTTGTTAATTTTACACTAATCCGACTCGAGACCGGTATAATTTATTATTTTCT
GCATAGTTTTAATTTATAGTGGTTTTACCGTAGTTGCTTTATCTAATTCACAATCATCAT
CACACTGAAACGAGAAACAAAACATTATTGGTTGACAAAACTAAAGAGATGAATCATATT
ATGAAGAATATGATAAAATACTATTTAGAAAGAAAAAAGATTCAAAATTTGAAGTAGCAG
TACTATGGATTTTTGGAAAAACTCAGAGATTGCTAATCCTAATCCGGTGGAAATACATTG
GGGGTGTTGTGGATAGACTAAAAGGCCAAAGCAGAGTAAGCTGTGTGCCTGTGTCACACT
CACACACTCTACATATATAATAATACAAGCAAGGCTCGTTAAAGAACAATGGTTTCGACT
TTCTAAAGAATACTAATAATACCACTTGTTTTGTATAAGAGACAATCTCCTTAAACTATC
TTCTTCCCGTATACTGATTATCCCCATGATATATTGTGGTGTAAACAAATTGACGCTTAG
ACAACTTAATAACACATTGCGGACGTTTTTAATGTACTGGGGTGGTTTTTCTTTTCACCA
GTGAGACGGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTGCA

Last Updated on 06.12.2018 16:11