Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 175D10 and hit At5g37800 are shown.
Line ID 175D10
Locus At5g37800 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr5:15037127
Primers used for PCR LD03 - 8474, show primer details
   
Sequence Name 36-K116478-0022-175-D10C-LD03
GenBank Accession LN502364 [GenBank]
Sequencing primer gene specific primer, LD03: 5'-GATCTAGGTCTGTTTCTCGGGTAG-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>36-K116478-0022-175-D10C-LD03
CCCTTAATGTTATTCGTATCAGTGACTTCTAAACTTTGCATAGATGTATTATAGATTAAG
CTATTAACACTTAATTACATGCATAATATCTCAAAACTTAACAACACTTAGTTCAATTCA
TGAAAACATTTTATAAAAGATATCTTAAAGTAAAACTCAGAAACCAAACTTTTGCAACAT
CACATTACGCATACTTGGAGAATTACAAAACATACAAAAATAGAAACATACCTCCACATA
TATAACTATTACATATCTAATCTACTATAAGATTCCATGCTCGTGTGGACCGACGTCTGA
CATATCGTCGGTGACTTCAATGTGTTGGCTCTTACATAATTAAAGCCTTAAAGGAATCAA
TAACTTCTCGATCTGTAACGTCACCAATTAACTATTTTTTAAACCGAATTCAAAAGTGAT
GACTTGTTTGGTATTATAATTAATGCCGATACATTTAGTAACTAATTATTCTGCTATACT
TTTTGTTTTGGTCGGAATTATTCTGCTATACTTGTTTCTCTAGTTGAGTTACTATCTCGT
TGTGATGATGAGAGGATTGCGTCAATAGCTTCTTTAACTTGAGAAATGTCCGGAGCTTTC
CCTCCTTGTGCCGGCCAAAACTCATCGGCTGCAAGTACCTATAAAAAGACATAGTTTTTT
TGTTTATATCAATATACTTGAAAGACCCTACTTATATATGACATAGTATGATATATAGTT
GACGGAATGTTTGTTAAGATTAATTACCTTAACTTGTACTTGAAGAAACTTTACATAGCC
NATTGCTTTCTCAAGCATAGTTACCAAATCCACCTACATAAAAACCACCATAAAGATNTT
TAAAAAAAAAATTAGTACAGAAAAATATTTATTACGCTCTAGGTTTGAAAAAAAAGGTTA
CGATAAAATTAAATTTCTTATACATTTA
   
Sequence Name 11-K116477-0022-175-D10C-8409
GenBank Accession LN491281 [GenBank]
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>11-K116477-0022-175-D10C-8409
CATTTACATTGAATATATCATGGTACCAAGGTATGATAAATGTATAAGAAATTTAATTTT
ATCGTAACCTTTTTTTTCAAACCTAGAGCGTAATAAATATTTTTCTGTACTAATTTTTTT
TTAAAAATCTTTATGGTGGTTTTTATGTAGGTGGATTTGGTAACTATGCTTGAGAAAGCA
ATTGGCTATGTAAAGTTTCTTCAAGTACAAGTTAAGGTAATTAATCTTAACAAACATTCC
GTCAACTATATATCATACTATGTCATATATAAGTAGGGTCTTTCAAGTATATTGATATAA
ACAAAAAAACTATGTCTTTTTATAGGTACTTGCAGCCAATGAGTTTTGGCCGGCACAAGG
AGGGAAAGCTCCGGACATTTCTCAAGTTAAAGAAGCTATTGACGCAATCCTCTCATCATC
ACAACGAGATAGTAACTCAACTAGAGAAACAAGTATAGCAAAATAATTCCGACCAAAACA
AAAAGTATAGCAAAATAATTAGTTACTAAATGTATCGGCATTAATTATAATACCAAACAA
GTCATCACTTTTGAATTCGGTTTAAAAAATAGTTAATTGGTGACGTTACAGATCGAGAAG
TTATTGATTCCTTTAAGGCTTTAATTATGTAAGAGCCAACACATTGAAGTCACCGACAAT
ATGTCAAACGTCGGTCCACACGAGCATGGAATCTTATAGTAGATTAGATATGTAATAGTT
ATATATGTGGAGGTATGTTTCTATTTTTGTATGTTTTGTAATTCTCCAAGTATGCGTAAT
GTGATGTTGCAAAAGTTTGGTTTCTGAGTTTTACTTTAAGATATCTTTTATAAAATGTTT
TCATGAATTGAACTAAGTGTTGTTAAGTTTTGAGATATTATGCATGTAATTAAGTGT

Last Updated on 06.12.2018 16:11