Sequences from confirmation amplicon


Confirmation sequences for line 376D01 and hit At4g10380 are shown.
Line ID 376D01
Locus At4g10380 [Araport] [TAIR] [MIPS] [SIGnAL]
Deduced position of insertion Chr4:6433460
Primers used for PCR AW03 - 8474, show primer details
   
Sequence Name 35-K019175w-022-376-D01C-8409
GenBank Accession queueing for submission to ENA/GenBank
Sequencing primer T-DNA primer, 8409: 5'-ATATTGACCATCATACTCATTGC-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>35-K019175w-022-376-D01C-840
ATTTCCCGGACATGAAGCCATTTACAATTGAATATATCCTGGACACCGACTCACCTCATA
TTTCAATTTTATGGACTATATGTATGTTAGTTTATTGATCTTGTAACAATTAGTTTATTG
TTCTTGTGACAATGAGCTAATAGTCTTGACTATGATAACATTAATAAAATTAACACGCAA
GTTGCGTAAATATAATGGTTTGTTTTTGTTTTGACGAAAAATAAAACGGTCACGCTTATT
TATACTAAACGAAAAATAGTTAGATTTAATCGGTTTTGTTTTGCAATGACGAATACAAAG
TAGTTAAATATTACGTCAATTTACTTGTATTGTTTTTGTGAAAGATCTATGTTACGTATG
GTTTGGTTAGGTCTTTGATTCATTTAATTGTTGTGAGCGTTTTCTTTTTCTGTCCATGAC
GGAAGCAGCGCCACCGGATGGGATTCTTTTAGCGCAATCCACGGCTCTTGTCCTTTTATC
ATAACCAATAATATTACTCTCTAGAGTTAATCATTAACCAATAATATAACTCTAGAGTTA
ATCATTAACCAATAATATTAAAGTAGTGTTGTAATTCTTATGATTAGTGTTAATTATTTA
CGAATTTTTTCCTTGATATATAACATATGATTAATATTATGATTGG
   
Sequence Name 36-K019175w-022-376-D01C-AW03
GenBank Accession queueing for submission to ENA/GenBank
Sequencing primer gene specific primer, AW03: 5'-AACGAGCATCAACCAATCATAATA-3'
Sequence (A. th genome BLAST matches underlined) 
>36-K019175w-022-376-D01C-AW0
TCATATGTTATATATCAAGNGAAAAAATTCGTAAATAATTAACACTAATCATAAGAATTA
CAACACTACTTTAATATTATTGGTTAATGATTAACTCTAGAGTTATATTATTGGTTAATG
ATTAACTCTAGAGAGTAATATTATTGGTTATGATAAAAGGACAAGAGCCGTGGATTGCGC
TAAAAGAATCCCATCCGGTGGCGCTGCTTCCGTCATGGACAGAAAAAGAAAACGCTCACA
ACAATTAAATGAATCAAAGACCTAACCAAACCATACGTAACATAGATCTTTCACAAAAAC
AATACAAGTAAATTGACGTAATATTTAACTACTTTGTATTCGTCATTGCAAAACAAAACC
GATTAAATCTAACTATTTTTCGTTTAGTATAAATAAGCGTGACCGTTTTATTTTTCGTCA
AAACAAAAACAAACCATTATATTTACGCAACTTGCGTGTTAATTTTATTAATGTTATCAT
AGTCAAGACTATTAGCTCATTGTCACAAGAACAATAAACTAATTGTTACAAGATCAATAA
ACTAACATACATATAGTCCATAAAATTGAAATATGAGGTGAGTCGGTGTCCAGGATATAT
TCAATTGTAAATGGCTTCATGTCCGGGAAATCTACATGGATCAGCAATGAGTATGATGGT
CAATATGGAGAAAAAGAAAGAGTAATTACCAATTTTTTTTCAATTCAAAAATGTAGATGT
CCGCAGCGTTATTATAAAATGAAAGTACATTTTGATAAAACGA

Last Updated on 06.12.2018 16:11